More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0911 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0911  Dna-J like membrane chaperone protein  100 
 
 
262 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0269993  normal  0.373919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3203  Dna-J like membrane chaperone protein  99.24 
 
 
262 aa  535  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.967283 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3109  Dna-J like membrane chaperone protein  98.47 
 
 
262 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3633  Dna-J like membrane chaperone protein  95.42 
 
 
262 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1085  Dna-J like membrane chaperone protein  90.46 
 
 
262 aa  497  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367802  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0995  Dna-J like membrane chaperone protein  91.22 
 
 
262 aa  498  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.555246  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0983  Dna-J like membrane chaperone protein  89.31 
 
 
262 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.193447  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1052  Dna-J like membrane chaperone protein  89.31 
 
 
262 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0982922  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3306  Dna-J like membrane chaperone protein  89.31 
 
 
262 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.044478  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1020  Dna-J like membrane chaperone protein  72.52 
 
 
259 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.325317  normal  0.0319615 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0970  Dna-J like membrane chaperone protein  71.76 
 
 
259 aa  402  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0207673  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0885  Dna-J like membrane chaperone protein  68.7 
 
 
258 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00720639  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0868  Dna-J like membrane chaperone protein  65.78 
 
 
259 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2882  Dna-J like membrane chaperone protein  64.26 
 
 
259 aa  360  2e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450671  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3073  Dna-J like membrane chaperone protein  65.65 
 
 
257 aa  346  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70305  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2813  Dna-J like membrane chaperone protein  65.65 
 
 
256 aa  344  8e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603068  normal  0.639961 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3569  Dna-J like membrane chaperone protein  48.4 
 
 
277 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000771944  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0768  Dna-J like membrane chaperone protein  48.4 
 
 
277 aa  260  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128794  normal  0.0201885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3440  Dna-J like membrane chaperone protein  48.39 
 
 
277 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000544251  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3415  Dna-J like membrane chaperone protein  45.8 
 
 
284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.258634  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4522  Dna-J like membrane chaperone protein  47.27 
 
 
275 aa  252  5.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0728  Dna-J like membrane chaperone protein  47.1 
 
 
273 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000304706  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03410  Dna-J like membrane chaperone protein  44.14 
 
 
288 aa  247  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0106  Dna-J like membrane chaperone protein  47.08 
 
 
270 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000540131  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0099  Dna-J like membrane chaperone protein  47.08 
 
 
270 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0100  Dna-J like membrane chaperone protein  47.08 
 
 
270 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000327368  normal  0.0501049 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0104  Dna-J like membrane chaperone protein  47.08 
 
 
270 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141328  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0101  Dna-J like membrane chaperone protein  47.08 
 
 
270 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000130204  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1051  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  51.12 
 
 
268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  45.49 
 
 
271 aa  240  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000026636  normal  0.688624 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3544  heat shock protein DnaJ domain protein  45.13 
 
 
271 aa  238  8e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.15628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3600  Dna-J like membrane chaperone protein  45.13 
 
 
271 aa  238  8e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000271898  hitchhiker  0.00000323028 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0061  Dna-J like membrane chaperone protein  45.13 
 
 
271 aa  238  8e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000128159  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0049  Dna-J like membrane chaperone protein  45.13 
 
 
271 aa  238  9e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000477601  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0061  Dna-J like membrane chaperone protein  45.13 
 
 
271 aa  237  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000204638  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00059  Dna-J like membrane chaperone protein  45.13 
 
 
271 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00058  hypothetical protein  45.13 
 
 
271 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000167853  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  44.77 
 
 
271 aa  236  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000613097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0604  Dna-J like membrane chaperone protein  44.77 
 
 
273 aa  230  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000356276  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0372  Dna-J like membrane chaperone protein  46.33 
 
 
283 aa  230  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2865  Dna-J like membrane chaperone protein  43.73 
 
 
284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787957  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3631  Dna-J like membrane chaperone protein  42.01 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.181642  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001661  DnaJ-like protein DjlA  43.11 
 
 
284 aa  209  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1291  Dna-J like membrane chaperone protein  41.35 
 
 
289 aa  206  5e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3828  Dna-J like membrane chaperone protein  40.41 
 
 
296 aa  205  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00812  Dna-J like membrane chaperone protein  42.16 
 
 
286 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0104  Dna-J like membrane chaperone protein  39.48 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000467525  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2075  Dna-J like membrane chaperone protein  39.85 
 
 
270 aa  199  3e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000570933  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0567  Dna-J like membrane chaperone protein  38.1 
 
 
318 aa  185  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0100  heat shock protein DnaJ-like protein  38.46 
 
 
257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2106  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.08 
 
 
260 aa  182  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0606  Dna-J like membrane chaperone protein  40.73 
 
 
305 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0020  Dna-J like membrane chaperone protein  39.09 
 
 
276 aa  174  9e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0892  Dna-J like membrane chaperone protein  36.51 
 
 
257 aa  171  7.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1055  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.06 
 
 
267 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00001887  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2989  Dna-J like membrane chaperone protein  40.65 
 
 
264 aa  168  9e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1907  Dna-J like membrane chaperone protein  37.26 
 
 
271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2262  Dna-J like membrane chaperone protein  32.39 
 
 
296 aa  158  7e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2289  Dna-J like membrane chaperone protein  31.69 
 
 
296 aa  155  7e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.45 
 
 
268 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.2781  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1747  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.09 
 
 
251 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000151297  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4621  heat shock protein DnaJ, N-terminal  28.85 
 
 
255 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418995  normal  0.628986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0880  heat shock protein DnaJ domain protein  31.42 
 
 
241 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161205  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5129  heat shock protein DnaJ-like  28.09 
 
 
255 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.583171  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4007  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.69 
 
 
253 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0905  protein of unknown function DUF1332  29.34 
 
 
241 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0299728  normal  0.285713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0942  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.34 
 
 
241 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0233536  normal  0.0990554 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2408  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.97 
 
 
236 aa  93.2  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.553614  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0557  DnaJ-like protein DjlA, putative  27.31 
 
 
255 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4795  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.5 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424531  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0961  hypothetical protein  31.75 
 
 
257 aa  89.7  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.483965  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0438  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.08 
 
 
255 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4909  protein of unknown function DUF1332  27.97 
 
 
245 aa  89  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296192  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0441  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.63 
 
 
255 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524438  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0407  heat shock protein DnaJ domain protein  28.63 
 
 
255 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4375  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.34 
 
 
240 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.283206  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2006  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.1 
 
 
246 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0210769 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1630  silent information regulator protein Sir2  26.79 
 
 
244 aa  85.5  7e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071584  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0397  heat shock protein DnaJ-like  27.71 
 
 
250 aa  82  0.000000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0557  DnaJ domain-containing protein  28.44 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.223519  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0742  hypothetical protein  29.27 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07800  hypothetical protein  29.86 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0234725 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1837  DnaJ domain-containing protein  25.7 
 
 
264 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0668  DnaJ domain-containing protein  24.68 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.165012  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46770  heat shock protein DnaJ-like protein  29.61 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2252  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.38 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1445  DnaJ domain-containing protein  27.31 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0302292  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2092  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.764372  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2884  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.37 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842041  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1401  DnaJ domain-containing protein  26.85 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.382181  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3726  heat shock protein DnaJ domain protein  51.56 
 
 
121 aa  68.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1731  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.1 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0785  putative heat shock protein DnaJ  22.47 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3389  heat shock protein DnaJ-like  25.65 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2441  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  22.47 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.525604  hitchhiker  0.00758559 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0546  DnaJ-like protein  23.45 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1860  heat shock protein DnaJ-like  21.72 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2868  protein of unknown function DUF1332  37.04 
 
 
235 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0737  heat shock protein DnaJ domain protein  30.43 
 
 
227 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120141  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0977  DnaJ domain-containing protein  25.25 
 
 
212 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>