78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2855 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2855  helix-turn-helix, AraC type  100 
 
 		 131 aa  276  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.893411 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1148  chaperone protein DnaJ  33.73 
 
 		 359 aa  50.8  0.000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.697031  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1208  heat shock protein DnaJ domain protein  35.94 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 		 372 aa  47.8  0.00005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0687  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.23 
 
 		 219 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365833 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0725  putative DnaJ-related protein  50 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  34.48 
 
 		 320 aa  45.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0675  heat shock protein  33.8 
 
 		 276 aa  44.7  0.0005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.745295  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  41.67 
 
 		 325 aa  44.3  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00670  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  46 
 
 		 321 aa  44.3  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.772796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0739  chaperone protein DnaJ  41.43 
 
 		 355 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1134  chaperone protein DnaJ  41.07 
 
 		 362 aa  43.9  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0830  heat shock protein DnaJ-like  43.14 
 
 		 365 aa  43.5  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3432  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 		 388 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0520699  normal  0.082957 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  38.71 
 
 		 298 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0364  chaperone protein DnaJ  42.62 
 
 		 389 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0319  heat shock protein DnaJ domain protein  40.32 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0096  chaperone DnaJ domain protein  39.34 
 
 		 310 aa  42.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.274204 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  36.51 
 
 		 383 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0231  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.8 
 
 		 393 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208592  normal  0.303974 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2511  heat shock protein DnaJ domain protein  38.71 
 
 		 316 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0350748  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2191  chaperone DnaJ domain protein  41.51 
 
 		 374 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2107  heat shock protein DnaJ-like  42.31 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0565  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.82 
 
 		 220 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  34.38 
 
 		 387 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4268  chaperone protein DnaJ  40.32 
 
 		 400 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.380859  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  32.89 
 
 		 335 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 		 380 aa  41.6  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  32.89 
 
 		 335 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1339  DnaJ domain-containing protein  45.83 
 
 		 86 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.927719  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1571  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.81 
 
 		 348 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.1 
 
 		 315 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1225  chaperone protein DnaJ  46.15 
 
 		 378 aa  41.6  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18463  normal  0.0136736 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04192  DnaJ and TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G05900)  45.83 
 
 		 634 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.107548  normal  0.45593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0979  hypothetical protein  38.46 
 
 		 379 aa  41.2  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6429  chaperone DnaJ domain protein  40 
 
 		 324 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0083  chaperone protein DnaJ  35.94 
 
 		 374 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0203  chaperone DnaJ domain protein  42.37 
 
 		 333 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00279971  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01120  chaperone regulator, putative  39.29 
 
 		 361 aa  41.2  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3219  chaperone protein DnaJ  44.23 
 
 		 376 aa  41.2  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36016  predicted protein  42.31 
 
 		 455 aa  41.2  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.941412  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1034  DnaJ domain-containing protein  35.59 
 
 		 212 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0627693  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0977  DnaJ domain-containing protein  35.59 
 
 		 212 aa  41.2  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49716  predicted protein  41.67 
 
 		 598 aa  41.6  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.732507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3786  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.14 
 
 		 219 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0728  DnaJ family protein  46.3 
 
 		 209 aa  41.2  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0797  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.25 
 
 		 219 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1872  chaperone protein DnaJ  35.82 
 
 		 395 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000340868  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  42.59 
 
 		 378 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0827  DnaJ domain-containing protein  35.59 
 
 		 212 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4805  chaperone protein DnaJ  45.76 
 
 		 406 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0213  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.25 
 
 		 291 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09651  DnaJ2 protein  40.74 
 
 		 319 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.270977  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0978  chaperone protein DnaJ  44 
 
 		 381 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  32.84 
 
 		 296 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04620  co-chaperone, putative  44.64 
 
 		 522 aa  40.8  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0013  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.74 
 
 		 302 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000027802  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3220  chaperone protein DnaJ  43.4 
 
 		 374 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000114884  hitchhiker  0.0000204508 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1019  heat shock protein DnaJ-like  46.15 
 
 		 177 aa  40.4  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4354  chaperone DnaJ-like  43.55 
 
 		 396 aa  40.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0918  chaperone protein DnaJ  35.8 
 
 		 377 aa  40.8  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.343225 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0789  chaperone protein DnaJ  36.84 
 
 		 377 aa  40.4  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  39.22 
 
 		 375 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0819  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.11 
 
 		 219 aa  40.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  40.38 
 
 		 385 aa  40.4  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2171  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.55 
 
 		 164 aa  40.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1855  dnaJ protein  42.31 
 
 		 377 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1525  chaperone protein DnaJ  40.74 
 
 		 380 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1280  DnaJ domain protein  40 
 
 		 353 aa  40  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0971  chaperone protein DnaJ  38.46 
 
 		 359 aa  40.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13440  chaperone protein DnaJ  33.87 
 
 		 372 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3070  chaperone DnaJ domain protein  35.06 
 
 		 315 aa  40.4  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  36.51 
 
 		 311 aa  40.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40349  predicted protein  28.79 
 
 		 198 aa  40.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0014  phage prohead protease  44.23 
 
 		 294 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000172  DnaJ-related protein  40.32 
 
 		 206 aa  40  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_7924  chaperone, dnaj-like protein  40.38 
 
 		 66 aa  40  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1024  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.35 
 
 		 223 aa  40  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>