178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0319 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0319  heat shock protein DnaJ domain protein  100 
 
 
199 aa  410  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3428  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  65.69 
 
 
206 aa  260  8e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6741  heat shock protein DnaJ domain protein  51.22 
 
 
206 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.450811  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3697  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  51.44 
 
 
208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6495  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  48.06 
 
 
206 aa  188  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0284031  decreased coverage  0.00341928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3555  heat shock protein DnaJ domain protein  45.69 
 
 
235 aa  185  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596429  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3231  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.69 
 
 
235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3426  heat shock protein DnaJ domain protein  45.73 
 
 
237 aa  180  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3592  heat shock protein DnaJ domain protein  43 
 
 
205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.329646  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2561  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.93 
 
 
211 aa  178  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.747799 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0401  heat shock protein DnaJ  48.84 
 
 
232 aa  177  7e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.337808 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3885  heat shock protein DnaJ domain protein  44.06 
 
 
205 aa  177  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3068  heat shock protein DnaJ-like  46.45 
 
 
206 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0913  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.79 
 
 
209 aa  176  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4048  molecular chaperone DnaJ family  42.36 
 
 
223 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292979  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2024  DnaJ domain-containing protein  42.06 
 
 
209 aa  174  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0763655  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1947  DnaJ domain-containing protein  42.06 
 
 
209 aa  174  7e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.673449  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0536  heat shock protein DnaJ-like  46.92 
 
 
219 aa  171  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.957898  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0496  heat shock protein DnaJ-like  44.55 
 
 
218 aa  170  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0539  heat shock protein DnaJ-like  48.08 
 
 
215 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0290  heat shock protein DnaJ-like  46.63 
 
 
215 aa  167  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0081  DnaJ domain-containing protein  40.8 
 
 
206 aa  167  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0501  heat shock protein DnaJ domain protein  49.05 
 
 
214 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7569  hypothetical protein  47.57 
 
 
189 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.57 
 
 
197 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884874  normal  0.323014 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5215  heat shock protein DnaJ domain protein  41.18 
 
 
202 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.134163 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2278  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.23 
 
 
204 aa  123  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.52692  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5127  molecular chaperone DnaJ family  34.01 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.31 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107685  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1874  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.79 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535727  normal  0.714616 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1713  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.07 
 
 
187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6075  heat shock protein DnaJ domain protein  34.47 
 
 
202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6015  heat shock protein DnaJ domain protein  35.78 
 
 
201 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0117  heat shock protein DnaJ domain protein  39.39 
 
 
176 aa  104  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233042  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1861  heat shock protein DnaJ-like  36.17 
 
 
210 aa  103  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.921437  normal  0.0227918 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0205  heat shock protein DnaJ-like  36.57 
 
 
203 aa  101  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3077  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.14 
 
 
211 aa  101  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1202  heat shock protein DnaJ domain protein  32.35 
 
 
209 aa  99.8  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.370648  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1978  DnaJ family molecular chaperone  30.1 
 
 
211 aa  94.7  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0688  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.1 
 
 
211 aa  94.7  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1876  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.94 
 
 
134 aa  94  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2332  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.53 
 
 
200 aa  93.2  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0679914  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0645  heat shock protein DnaJ-like  32.58 
 
 
208 aa  92.4  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147986  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2910  heat shock protein DnaJ-like  32.64 
 
 
196 aa  91.7  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294745  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0646  heat shock protein DnaJ-like protein  33.87 
 
 
176 aa  89.4  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607248  normal  0.0426843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2948  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.55 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133197  normal  0.0175295 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1019  heat shock protein DnaJ-like  26.04 
 
 
177 aa  51.6  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  39.66 
 
 
380 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0506  heat shock protein DnaJ-like  45.1 
 
 
330 aa  50.1  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366766  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2579  heat shock protein DnaJ-like  45.83 
 
 
294 aa  50.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0330  chaperone protein DnaJ  45.1 
 
 
379 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1748  heat shock protein DnaJ-like protein  28.4 
 
 
181 aa  50.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.405714  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4473  chaperone protein DnaJ  42 
 
 
376 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.264667  normal  0.173386 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1829  heat shock protein DnaJ-like  43.14 
 
 
318 aa  48.1  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2480  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.14 
 
 
317 aa  48.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129591  normal  0.116583 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0198  chaperone protein DnaJ  45.1 
 
 
378 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  38.46 
 
 
330 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0430  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
379 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4415  chaperone protein DnaJ  37.93 
 
 
375 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0390  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
386 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0156  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 
377 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1520  heat shock protein DnaJ domain protein  41.18 
 
 
228 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  42.86 
 
 
339 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4095  chaperone protein DnaJ  37.93 
 
 
376 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  41.67 
 
 
311 aa  46.2  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  40.82 
 
 
373 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
375 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0974  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.18 
 
 
316 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.583857 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3573  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
385 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.856531  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  38 
 
 
330 aa  46.2  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.82 
 
 
324 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  38 
 
 
379 aa  45.4  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
386 aa  45.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5358  predicted protein  34.55 
 
 
294 aa  45.4  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.653012  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  42.86 
 
 
325 aa  45.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0934  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.78 
 
 
320 aa  45.4  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0828376 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0013  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.86 
 
 
302 aa  45.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000027802  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3900  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.67 
 
 
313 aa  45.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2536  heat shock protein DnaJ-like  47.17 
 
 
177 aa  45.1  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230081  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2102  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44 
 
 
312 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0238412 
 
 
-
 
NC_002936  DET1411  DnaJ family protein  36.54 
 
 
330 aa  45.1  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6365  chaperone DnaJ domain protein  40 
 
 
304 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0593575  normal  0.238878 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2225  heat shock protein DnaJ domain protein  36.51 
 
 
182 aa  44.7  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.316967  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  38.78 
 
 
383 aa  44.7  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1805  heat shock protein DnaJ domain protein  40.82 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0198  chaperone protein DnaJ  39.58 
 
 
404 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0132968  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  33.33 
 
 
373 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0083  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
374 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  42.86 
 
 
326 aa  43.9  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
380 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.78 
 
 
315 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02351  DnaJ-like molecular chaperone  32.73 
 
 
312 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  38 
 
 
386 aa  44.3  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12140  predicted protein  36 
 
 
304 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  32.69 
 
 
382 aa  43.9  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  38 
 
 
376 aa  43.5  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  36 
 
 
380 aa  43.5  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  38 
 
 
376 aa  43.5  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.42 
 
 
325 aa  43.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  38 
 
 
376 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>