218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5127 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5127  molecular chaperone DnaJ family  100 
 
 		 202 aa  421  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5215  heat shock protein DnaJ domain protein  72.28 
 
 		 202 aa  316  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.134163 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6075  heat shock protein DnaJ domain protein  74.26 
 
 		 202 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6015  heat shock protein DnaJ domain protein  73.76 
 
 		 201 aa  299  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4048  molecular chaperone DnaJ family  50.48 
 
 		 223 aa  194  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292979  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3885  heat shock protein DnaJ domain protein  50.24 
 
 		 205 aa  191  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3592  heat shock protein DnaJ domain protein  49.28 
 
 		 205 aa  191  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.329646  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2561  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  48.57 
 
 		 211 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.747799 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0913  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.37 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2024  DnaJ domain-containing protein  43.98 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0763655  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1947  DnaJ domain-containing protein  43.98 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.673449  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0081  DnaJ domain-containing protein  42.58 
 
 		 206 aa  165  4e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3068  heat shock protein DnaJ-like  42.38 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0401  heat shock protein DnaJ  37.99 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.337808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7569  hypothetical protein  38.98 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0496  heat shock protein DnaJ-like  37.7 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0536  heat shock protein DnaJ-like  39.11 
 
 		 219 aa  117  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.957898  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0319  heat shock protein DnaJ domain protein  34.01 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.34 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884874  normal  0.323014 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0539  heat shock protein DnaJ-like  37.64 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6741  heat shock protein DnaJ domain protein  32.72 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.450811  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0501  heat shock protein DnaJ domain protein  36.16 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0290  heat shock protein DnaJ-like  37.08 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3697  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.23 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.700158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6495  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.87 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0284031  decreased coverage  0.00341928 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3428  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.65 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3426  heat shock protein DnaJ domain protein  35.11 
 
 		 237 aa  105  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3555  heat shock protein DnaJ domain protein  32.49 
 
 		 235 aa  104  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596429  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3231  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.85 
 
 		 235 aa  104  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2278  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.41 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.52692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1876  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.04 
 
 		 134 aa  84  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2910  heat shock protein DnaJ-like  29.32 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294745  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1713  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.44 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1861  heat shock protein DnaJ-like  29.78 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.921437  normal  0.0227918 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2332  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.39 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0679914  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1202  heat shock protein DnaJ domain protein  31.09 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.370648  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.11 
 
 		 216 aa  72  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1874  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.22 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535727  normal  0.714616 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0645  heat shock protein DnaJ-like  28.93 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147986  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3077  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.05 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0205  heat shock protein DnaJ-like  28.21 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1978  DnaJ family molecular chaperone  28.42 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0688  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.42 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0646  heat shock protein DnaJ-like protein  24.85 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607248  normal  0.0426843 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0117  heat shock protein DnaJ domain protein  25.88 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233042  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0198  chaperone protein DnaJ  41.07 
 
 		 404 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0132968  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2732  chaperone protein DnaJ  39.22 
 
 		 374 aa  50.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000152871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  37.25 
 
 		 372 aa  49.3  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3220  chaperone protein DnaJ  38.46 
 
 		 374 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000114884  hitchhiker  0.0000204508 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38560  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 		 387 aa  48.9  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0413563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  39.22 
 
 		 382 aa  48.9  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5306  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.31 
 
 		 297 aa  48.9  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.764434 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10357  chaperone protein DnaJ  37.5 
 
 		 395 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0119746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 		 372 aa  48.1  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  39.22 
 
 		 388 aa  47.8  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 		 386 aa  47.4  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  35.29 
 
 		 377 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  39.22 
 
 		 381 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4268  chaperone protein DnaJ  37.5 
 
 		 400 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.380859  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  39.22 
 
 		 384 aa  47  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0009  chaperone protein DnaJ  37.25 
 
 		 376 aa  46.6  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0447538  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  35.71 
 
 		 380 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  35.29 
 
 		 333 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3820  chaperone protein DnaJ  37.25 
 
 		 378 aa  45.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0535  chaperone protein DnaJ  39.22 
 
 		 379 aa  45.8  0.0004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1577  chaperone DnaJ  39.22 
 
 		 377 aa  46.2  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.277961  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1776  chaperone protein DnaJ  35.29 
 
 		 383 aa  45.4  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2162  chaperone protein DnaJ  35.09 
 
 		 367 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0005  chaperone protein DnaJ  37.25 
 
 		 382 aa  45.4  0.0005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0025  chaperone protein DnaJ  37.25 
 
 		 380 aa  45.8  0.0005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  37.25 
 
 		 373 aa  45.8  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6947  chaperone protein DnaJ  35.71 
 
 		 398 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1264  heat shock protein DnaJ domain protein  41.18 
 
 		 307 aa  45.4  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0110281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  35.29 
 
 		 384 aa  45.1  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  32.14 
 
 		 387 aa  45.4  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.29 
 
 		 334 aa  45.1  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0013  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.29 
 
 		 302 aa  45.1  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000027802  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1630  silent information regulator protein Sir2  41.67 
 
 		 244 aa  45.1  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071584  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0441  chaperone protein DnaJ  33.33 
 
 		 378 aa  45.1  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000821274  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.29 
 
 		 324 aa  45.1  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0979  hypothetical protein  37.25 
 
 		 379 aa  45.1  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127432 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  35.29 
 
 		 377 aa  44.7  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0014  phage prohead protease  41.18 
 
 		 294 aa  45.1  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2235  chaperone protein DnaJ  37.25 
 
 		 375 aa  45.1  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0177525  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.22 
 
 		 320 aa  45.1  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  39.22 
 
 		 376 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1972  chaperone protein DnaJ  37.25 
 
 		 375 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000781589 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  35.29 
 
 		 297 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  35.29 
 
 		 335 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  39.22 
 
 		 379 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  39.22 
 
 		 298 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0979  chaperone DnaJ-like  35.29 
 
 		 401 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109475 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  35.29 
 
 		 375 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1768  heat shock protein DnaJ-like  34.55 
 
 		 415 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0454464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3570  chaperone protein DnaJ  36.54 
 
 		 383 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18790  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  35.29 
 
 		 325 aa  43.9  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0641376  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1011  chaperone DnaJ domain protein  37.25 
 
 		 294 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0982  chaperone DnaJ domain protein  37.25 
 
 		 294 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1995  chaperone protein DnaJ  37.25 
 
 		 379 aa  44.3  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.396046  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  39.22 
 
 		 379 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>