238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3555 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3231  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  99.57 
 
 
235 aa  476  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3555  heat shock protein DnaJ domain protein  100 
 
 
235 aa  478  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596429  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3426  heat shock protein DnaJ domain protein  84.45 
 
 
237 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3697  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  71.06 
 
 
208 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6741  heat shock protein DnaJ domain protein  69.79 
 
 
206 aa  315  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.450811  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6495  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  65.96 
 
 
206 aa  298  6e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0284031  decreased coverage  0.00341928 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3428  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50.21 
 
 
206 aa  218  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0319  heat shock protein DnaJ domain protein  45.69 
 
 
199 aa  193  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0536  heat shock protein DnaJ-like  45.92 
 
 
219 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.957898  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3068  heat shock protein DnaJ-like  42.98 
 
 
206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0913  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.86 
 
 
209 aa  175  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2024  DnaJ domain-containing protein  42.62 
 
 
209 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0763655  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1947  DnaJ domain-containing protein  42.62 
 
 
209 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.673449  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0401  heat shock protein DnaJ  45.22 
 
 
232 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.337808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0539  heat shock protein DnaJ-like  44.02 
 
 
215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2561  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.5 
 
 
211 aa  172  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.747799 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3592  heat shock protein DnaJ domain protein  39.66 
 
 
205 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.329646  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0290  heat shock protein DnaJ-like  42.74 
 
 
215 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0496  heat shock protein DnaJ-like  45.73 
 
 
218 aa  170  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3885  heat shock protein DnaJ domain protein  39.24 
 
 
205 aa  168  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4048  molecular chaperone DnaJ family  39.41 
 
 
223 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292979  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0501  heat shock protein DnaJ domain protein  42.13 
 
 
214 aa  164  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7569  hypothetical protein  46.81 
 
 
189 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0081  DnaJ domain-containing protein  37.02 
 
 
206 aa  160  1e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.5 
 
 
197 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884874  normal  0.323014 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1874  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.75 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535727  normal  0.714616 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2278  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.62 
 
 
204 aa  122  7e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.52692  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0205  heat shock protein DnaJ-like  36.27 
 
 
203 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1713  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.83 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1876  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.22 
 
 
134 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5215  heat shock protein DnaJ domain protein  35.08 
 
 
202 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.134163 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1861  heat shock protein DnaJ-like  33.64 
 
 
210 aa  109  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.921437  normal  0.0227918 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5127  molecular chaperone DnaJ family  33.51 
 
 
202 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.61 
 
 
216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107685  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2332  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.34 
 
 
200 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0679914  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0117  heat shock protein DnaJ domain protein  31.69 
 
 
176 aa  105  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233042  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3077  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.09 
 
 
211 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0645  heat shock protein DnaJ-like  32.87 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147986  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6015  heat shock protein DnaJ domain protein  31.79 
 
 
201 aa  99  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6075  heat shock protein DnaJ domain protein  31.79 
 
 
202 aa  99  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1978  DnaJ family molecular chaperone  31.6 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0688  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.6 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0646  heat shock protein DnaJ-like protein  35.29 
 
 
176 aa  92.8  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607248  normal  0.0426843 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1202  heat shock protein DnaJ domain protein  30.24 
 
 
209 aa  91.7  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.370648  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2910  heat shock protein DnaJ-like  32.66 
 
 
196 aa  91.3  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294745  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  37.7 
 
 
324 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  44 
 
 
372 aa  52  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  44.9 
 
 
383 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2480  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.82 
 
 
317 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129591  normal  0.116583 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2579  heat shock protein DnaJ-like  44.9 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 
377 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  42.86 
 
 
373 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2948  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.26 
 
 
176 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133197  normal  0.0175295 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0506  heat shock protein DnaJ-like  41.18 
 
 
330 aa  50.1  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366766  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1019  heat shock protein DnaJ-like  41.07 
 
 
177 aa  50.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4473  chaperone protein DnaJ  40.74 
 
 
376 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.264667  normal  0.173386 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3573  chaperone protein DnaJ  36.36 
 
 
385 aa  49.3  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.856531  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  37.29 
 
 
382 aa  48.9  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  45.83 
 
 
380 aa  48.9  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12140  predicted protein  37.1 
 
 
304 aa  48.9  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5358  predicted protein  38.6 
 
 
294 aa  48.9  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.653012  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1520  heat shock protein DnaJ domain protein  40.82 
 
 
228 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  35.19 
 
 
379 aa  48.5  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  38.6 
 
 
386 aa  48.5  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.29 
 
 
324 aa  48.5  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  35.71 
 
 
386 aa  48.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0083  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
374 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2290  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
375 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00256335 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  44.9 
 
 
387 aa  48.5  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2664  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
375 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02351  DnaJ-like molecular chaperone  34.48 
 
 
312 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1571  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46 
 
 
348 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  39.29 
 
 
297 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0629  chaperone protein DnaJ  35.09 
 
 
393 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1829  heat shock protein DnaJ-like  38.89 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  37.29 
 
 
379 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  37.29 
 
 
379 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  37.29 
 
 
379 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  37.29 
 
 
379 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  37.29 
 
 
379 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3014  heat shock protein DnaJ domain protein  36.36 
 
 
458 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  38.78 
 
 
307 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  35.19 
 
 
389 aa  46.6  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0330  chaperone protein DnaJ  35.59 
 
 
379 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  40.82 
 
 
311 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2209  chaperone DnaJ domain protein  40 
 
 
374 aa  46.6  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.990749  hitchhiker  0.0052734 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1475  chaperone protein DnaJ  37.29 
 
 
385 aa  47  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.82 
 
 
315 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  38 
 
 
376 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06170  DnaJ domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08300)  42.86 
 
 
418 aa  46.2  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.281227 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  38 
 
 
376 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  38 
 
 
376 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0198  chaperone protein DnaJ  38.78 
 
 
404 aa  46.2  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0132968  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  38 
 
 
376 aa  46.2  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  38 
 
 
376 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  38 
 
 
376 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  38 
 
 
376 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  37.74 
 
 
382 aa  46.2  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0544  chaperone DnaJ domain protein  36.73 
 
 
291 aa  46.2  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.71 
 
 
289 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>