254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0645 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0645  heat shock protein DnaJ-like  100 
 
 		 208 aa  434  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147986  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1202  heat shock protein DnaJ domain protein  74.64 
 
 		 209 aa  330  1e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.370648  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1861  heat shock protein DnaJ-like  70.19 
 
 		 210 aa  304  5.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.921437  normal  0.0227918 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3077  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  60 
 
 		 211 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1874  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  62.2 
 
 		 208 aa  271  5.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535727  normal  0.714616 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1978  DnaJ family molecular chaperone  59.05 
 
 		 211 aa  268  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0688  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  59.05 
 
 		 211 aa  268  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2910  heat shock protein DnaJ-like  34.9 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294745  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2278  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.17 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.52692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1713  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.15 
 
 		 187 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2332  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.82 
 
 		 200 aa  104  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0679914  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0501  heat shock protein DnaJ domain protein  35.36 
 
 		 214 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0539  heat shock protein DnaJ-like  34.62 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0205  heat shock protein DnaJ-like  35.47 
 
 		 203 aa  101  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0290  heat shock protein DnaJ-like  34.62 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3068  heat shock protein DnaJ-like  32.28 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3428  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.77 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.92 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0401  heat shock protein DnaJ  35 
 
 		 232 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.337808 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0117  heat shock protein DnaJ domain protein  32.92 
 
 		 176 aa  97.1  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233042  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3697  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.6 
 
 		 208 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.700158 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3885  heat shock protein DnaJ domain protein  30.89 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4048  molecular chaperone DnaJ family  29.25 
 
 		 223 aa  95.5  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292979  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0496  heat shock protein DnaJ-like  32.34 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0913  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.82 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3592  heat shock protein DnaJ domain protein  29.84 
 
 		 205 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.329646  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0319  heat shock protein DnaJ domain protein  32.58 
 
 		 199 aa  92.4  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_004310  BR2024  DnaJ domain-containing protein  30.33 
 
 		 209 aa  92  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0763655  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1947  DnaJ domain-containing protein  30.33 
 
 		 209 aa  92  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.673449  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0536  heat shock protein DnaJ-like  30.84 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.957898  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0081  DnaJ domain-containing protein  30.53 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7569  hypothetical protein  34.07 
 
 		 189 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2561  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30 
 
 		 211 aa  89.4  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.747799 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6741  heat shock protein DnaJ domain protein  31.89 
 
 		 206 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.450811  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.68 
 
 		 197 aa  89.7  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884874  normal  0.323014 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0646  heat shock protein DnaJ-like protein  32.57 
 
 		 176 aa  89.4  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607248  normal  0.0426843 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3426  heat shock protein DnaJ domain protein  30.81 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6495  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.25 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0284031  decreased coverage  0.00341928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3555  heat shock protein DnaJ domain protein  31.22 
 
 		 235 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596429  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3231  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.22 
 
 		 235 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1019  heat shock protein DnaJ-like  29.84 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2948  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.87 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133197  normal  0.0175295 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6075  heat shock protein DnaJ domain protein  30 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6015  heat shock protein DnaJ domain protein  30 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5127  molecular chaperone DnaJ family  28.93 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1748  heat shock protein DnaJ-like protein  31.1 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.405714  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5215  heat shock protein DnaJ domain protein  25.29 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.134163 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1876  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.03 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5306  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.15 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.764434 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3908  chaperone DnaJ domain protein  42.11 
 
 		 301 aa  52.8  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  42.31 
 
 		 372 aa  53.1  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7804  putative heat shock protein- DnaJ-like protein  45.1 
 
 		 336 aa  52.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5925  heat shock protein DnaJ domain protein  44.44 
 
 		 279 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  38.98 
 
 		 382 aa  52.4  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6365  chaperone DnaJ domain protein  42.31 
 
 		 304 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0593575  normal  0.238878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0787  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.45 
 
 		 292 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0083  chaperone protein DnaJ  40.74 
 
 		 374 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  42.11 
 
 		 386 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.59 
 
 		 320 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 		 379 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 		 379 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0974  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.4 
 
 		 316 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583857 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6186  chaperone DnaJ domain protein  40.38 
 
 		 304 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.364765 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2209  chaperone DnaJ domain protein  39.62 
 
 		 374 aa  48.9  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.990749  hitchhiker  0.0052734 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  37.93 
 
 		 372 aa  48.9  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  37.93 
 
 		 377 aa  48.9  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0800  chaperone protein DnaJ  42.31 
 
 		 378 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  38.98 
 
 		 378 aa  48.5  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  37.29 
 
 		 379 aa  48.5  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.14 
 
 		 334 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0231  chaperone DnaJ domain-containing protein  44 
 
 		 393 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208592  normal  0.303974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  40.38 
 
 		 340 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  37.1 
 
 		 387 aa  47.8  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  38.46 
 
 		 386 aa  48.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2843  chaperone protein DnaJ  38.98 
 
 		 376 aa  47.8  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0744929  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  35.85 
 
 		 374 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3536  chaperone protein DnaJ  35.59 
 
 		 377 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  37.29 
 
 		 318 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3820  chaperone protein DnaJ  39.66 
 
 		 378 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.14 
 
 		 324 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  33.33 
 
 		 373 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  37.29 
 
 		 318 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3573  chaperone protein DnaJ  34.43 
 
 		 385 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.856531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  36.54 
 
 		 374 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  37.29 
 
 		 378 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0970  chaperone protein DnaJ  37.29 
 
 		 376 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  38.98 
 
 		 376 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  37.29 
 
 		 318 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3619  chaperone DnaJ domain protein  37.74 
 
 		 326 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.38 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5358  predicted protein  37.29 
 
 		 294 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.653012  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.38 
 
 		 287 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  37.29 
 
 		 378 aa  46.6  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2810  heat shock protein DnaJ  37.29 
 
 		 380 aa  46.6  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00638264  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3410  chaperone protein DnaJ  35.59 
 
 		 377 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1043  chaperone protein DnaJ  35.59 
 
 		 377 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0054277  decreased coverage  0.0000000510426 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  36.54 
 
 		 373 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4013  chaperone DnaJ-like  37.5 
 
 		 333 aa  46.2  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.183455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0958  chaperone protein DnaJ  37.29 
 
 		 377 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0996  chaperone protein DnaJ  37.29 
 
 		 377 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.406882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>