More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4048 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4048  molecular chaperone DnaJ family  100 
 
 		 223 aa  467  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292979  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2561  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  75 
 
 		 211 aa  335  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.747799 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3592  heat shock protein DnaJ domain protein  77.03 
 
 		 205 aa  332  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.329646  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3885  heat shock protein DnaJ domain protein  77.03 
 
 		 205 aa  329  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_004310  BR2024  DnaJ domain-containing protein  60.95 
 
 		 209 aa  263  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0763655  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1947  DnaJ domain-containing protein  60.95 
 
 		 209 aa  263  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.673449  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3068  heat shock protein DnaJ-like  61.43 
 
 		 206 aa  259  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0913  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  60.48 
 
 		 209 aa  257  9e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0081  DnaJ domain-containing protein  52.86 
 
 		 206 aa  239  2e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5215  heat shock protein DnaJ domain protein  50.72 
 
 		 202 aa  201  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.134163 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6075  heat shock protein DnaJ domain protein  50.72 
 
 		 202 aa  198  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5127  molecular chaperone DnaJ family  50.48 
 
 		 202 aa  194  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6015  heat shock protein DnaJ domain protein  49.04 
 
 		 201 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6741  heat shock protein DnaJ domain protein  45.33 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.450811  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.35 
 
 		 197 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884874  normal  0.323014 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3697  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.06 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.700158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6495  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.39 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0284031  decreased coverage  0.00341928 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0319  heat shock protein DnaJ domain protein  42.36 
 
 		 199 aa  176  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3428  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.78 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0401  heat shock protein DnaJ  43.06 
 
 		 232 aa  169  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.337808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0536  heat shock protein DnaJ-like  42.27 
 
 		 219 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.957898  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0496  heat shock protein DnaJ-like  40.64 
 
 		 218 aa  168  7e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0290  heat shock protein DnaJ-like  41.74 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7569  hypothetical protein  45.16 
 
 		 189 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0539  heat shock protein DnaJ-like  40.83 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3555  heat shock protein DnaJ domain protein  37.45 
 
 		 235 aa  155  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596429  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3231  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.19 
 
 		 235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0501  heat shock protein DnaJ domain protein  40.64 
 
 		 214 aa  154  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3426  heat shock protein DnaJ domain protein  42.25 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1876  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  51.08 
 
 		 134 aa  131  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2278  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.82 
 
 		 204 aa  131  9e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.52692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1713  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.78 
 
 		 187 aa  115  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0205  heat shock protein DnaJ-like  33.83 
 
 		 203 aa  113  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.71 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1874  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.89 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535727  normal  0.714616 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0117  heat shock protein DnaJ domain protein  31.84 
 
 		 176 aa  102  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233042  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2910  heat shock protein DnaJ-like  34.39 
 
 		 196 aa  99.4  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294745  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1861  heat shock protein DnaJ-like  31.48 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.921437  normal  0.0227918 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3077  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.61 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0688  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.77 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1978  DnaJ family molecular chaperone  30.77 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0645  heat shock protein DnaJ-like  29.25 
 
 		 208 aa  95.5  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147986  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1202  heat shock protein DnaJ domain protein  30.56 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.370648  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2332  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.84 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0679914  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0646  heat shock protein DnaJ-like protein  32.79 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607248  normal  0.0426843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2948  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.18 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133197  normal  0.0175295 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  49.02 
 
 		 372 aa  62.4  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1748  heat shock protein DnaJ-like protein  28.73 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.405714  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  40.74 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  46.43 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  41.82 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  44.44 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.64 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1019  heat shock protein DnaJ-like  25.82 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 		 383 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  49.02 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1411  DnaJ family protein  41.82 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.59 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0114  chaperone protein DnaJ  46.43 
 
 		 391 aa  55.5  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000234642 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3573  chaperone protein DnaJ  44.23 
 
 		 385 aa  55.1  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.856531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  42.59 
 
 		 333 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0198  chaperone protein DnaJ  41.07 
 
 		 404 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0132968  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  41.82 
 
 		 318 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7804  putative heat shock protein- DnaJ-like protein  44.64 
 
 		 336 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  40.74 
 
 		 382 aa  54.3  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  41.82 
 
 		 318 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0383  chaperone protein DnaJ  44.44 
 
 		 381 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02238  DnaJ domain protein Psi, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07340)  43.64 
 
 		 377 aa  53.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542195  normal  0.0811515 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0562  chaperone protein DnaJ  39.29 
 
 		 376 aa  53.9  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.818243  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5358  predicted protein  44.44 
 
 		 294 aa  53.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.653012  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3900  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.06 
 
 		 313 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  39.22 
 
 		 377 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  41.18 
 
 		 373 aa  53.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0115  chaperone protein DnaJ  44.64 
 
 		 390 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0934  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.62 
 
 		 320 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0828376 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 		 388 aa  53.9  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  42.31 
 
 		 318 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03375  DnaJ domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G01230)  46.3 
 
 		 466 aa  53.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.698217  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0629  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 		 393 aa  53.5  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0083  chaperone protein DnaJ  45.1 
 
 		 374 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0351  chaperone DnaJ domain protein  40.68 
 
 		 334 aa  53.1  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.697421 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2992  chaperone DnaJ domain-containing protein  46.3 
 
 		 306 aa  53.1  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  43.14 
 
 		 298 aa  53.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 		 386 aa  53.5  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1988  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 		 379 aa  53.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.731806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6947  chaperone protein DnaJ  38.98 
 
 		 398 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 		 372 aa  52.8  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0675  heat shock protein  39.22 
 
 		 276 aa  52.8  0.000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.745295  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4268  chaperone protein DnaJ  41.38 
 
 		 400 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.380859  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  42.59 
 
 		 384 aa  52.8  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  43.14 
 
 		 297 aa  52.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  43.14 
 
 		 298 aa  52.4  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  40 
 
 		 318 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  43.14 
 
 		 297 aa  52.4  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  39.22 
 
 		 384 aa  52.8  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0025  chaperone protein DnaJ  39.22 
 
 		 380 aa  52.4  0.000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  39.29 
 
 		 387 aa  52.4  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  39.22 
 
 		 340 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  42.59 
 
 		 377 aa  52  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1525  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 		 380 aa  52  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>