More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1714 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
197 aa  408  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884874  normal  0.323014 
 
 
-
 
NC_004310  BR2024  DnaJ domain-containing protein  49.48 
 
 
209 aa  189  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0763655  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1947  DnaJ domain-containing protein  49.48 
 
 
209 aa  189  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.673449  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0913  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.92 
 
 
209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4048  molecular chaperone DnaJ family  46.35 
 
 
223 aa  180  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292979  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3885  heat shock protein DnaJ domain protein  46.15 
 
 
205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3592  heat shock protein DnaJ domain protein  46.15 
 
 
205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.329646  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2561  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.83 
 
 
211 aa  174  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.747799 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0081  DnaJ domain-containing protein  43.22 
 
 
206 aa  173  9.999999999999999e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3068  heat shock protein DnaJ-like  47.67 
 
 
206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0536  heat shock protein DnaJ-like  45.41 
 
 
219 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.957898  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0401  heat shock protein DnaJ  44.44 
 
 
232 aa  155  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.337808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0501  heat shock protein DnaJ domain protein  44.79 
 
 
214 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3428  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.27 
 
 
206 aa  152  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0496  heat shock protein DnaJ-like  44.44 
 
 
218 aa  152  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7569  hypothetical protein  46.19 
 
 
189 aa  150  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6741  heat shock protein DnaJ domain protein  45.26 
 
 
206 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.450811  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0539  heat shock protein DnaJ-like  43.23 
 
 
215 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0290  heat shock protein DnaJ-like  43.23 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3697  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.83 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700158 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3426  heat shock protein DnaJ domain protein  42.56 
 
 
237 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6495  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.5 
 
 
206 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0284031  decreased coverage  0.00341928 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0319  heat shock protein DnaJ domain protein  44.57 
 
 
199 aa  137  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3555  heat shock protein DnaJ domain protein  41.58 
 
 
235 aa  137  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596429  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0205  heat shock protein DnaJ-like  41.88 
 
 
203 aa  136  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3231  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.29 
 
 
235 aa  136  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5215  heat shock protein DnaJ domain protein  38.78 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.134163 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2278  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.42 
 
 
204 aa  124  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.52692  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1876  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50.72 
 
 
134 aa  124  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.21 
 
 
216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107685  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0117  heat shock protein DnaJ domain protein  40 
 
 
176 aa  115  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233042  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5127  molecular chaperone DnaJ family  34.34 
 
 
202 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6075  heat shock protein DnaJ domain protein  36.04 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6015  heat shock protein DnaJ domain protein  36.04 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1713  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.32 
 
 
187 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3077  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.33 
 
 
211 aa  101  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1874  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.16 
 
 
208 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535727  normal  0.714616 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2910  heat shock protein DnaJ-like  36.32 
 
 
196 aa  97.1  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294745  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1978  DnaJ family molecular chaperone  31.66 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0688  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.66 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0646  heat shock protein DnaJ-like protein  36.76 
 
 
176 aa  93.6  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607248  normal  0.0426843 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1202  heat shock protein DnaJ domain protein  33.17 
 
 
209 aa  91.3  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.370648  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0645  heat shock protein DnaJ-like  33.68 
 
 
208 aa  89.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147986  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2332  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.23 
 
 
200 aa  89.4  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0679914  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1861  heat shock protein DnaJ-like  34.03 
 
 
210 aa  88.6  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.921437  normal  0.0227918 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  44.64 
 
 
387 aa  58.5  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  46.43 
 
 
383 aa  58.2  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.86 
 
 
330 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1520  heat shock protein DnaJ domain protein  50 
 
 
228 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  43.86 
 
 
330 aa  54.7  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2948  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.93 
 
 
176 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133197  normal  0.0175295 
 
 
-
 
NC_002936  DET1411  DnaJ family protein  43.86 
 
 
330 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
372 aa  54.3  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
380 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3573  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 
385 aa  52.4  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.856531  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1933  heat shock protein DnaJ-like  49.09 
 
 
97 aa  52  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0426036  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0040  chaperone protein DnaJ  45.28 
 
 
372 aa  51.6  0.000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  44 
 
 
333 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5925  heat shock protein DnaJ domain protein  44.23 
 
 
279 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  38.18 
 
 
318 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5306  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.1 
 
 
297 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.764434 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  44 
 
 
320 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4013  chaperone DnaJ-like  42.86 
 
 
333 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.183455  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  38.18 
 
 
318 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  42 
 
 
377 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0198  chaperone protein DnaJ  35.71 
 
 
404 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0132968  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0527  chaperone protein DnaJ  39.29 
 
 
396 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  44.9 
 
 
373 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  38.6 
 
 
388 aa  49.3  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0083  chaperone protein DnaJ  36.84 
 
 
374 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0510  chaperone DnaJ domain-containing protein  48.15 
 
 
97 aa  48.9  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3127  chaperone protein DnaJ  44.23 
 
 
380 aa  49.3  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.82415  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  46.15 
 
 
337 aa  48.9  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  36.36 
 
 
318 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3900  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.83 
 
 
313 aa  48.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4268  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
400 aa  48.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.380859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  42 
 
 
297 aa  48.1  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0971  chaperone protein DnaJ  44.9 
 
 
359 aa  48.1  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  42 
 
 
297 aa  48.1  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  44 
 
 
381 aa  48.1  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  40.82 
 
 
318 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  41.51 
 
 
372 aa  47.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2579  heat shock protein DnaJ-like  45.83 
 
 
294 aa  47.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  42 
 
 
382 aa  47.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4354  chaperone DnaJ-like  40 
 
 
396 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3220  chaperone protein DnaJ  37.25 
 
 
374 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000114884  hitchhiker  0.0000204508 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  44 
 
 
302 aa  47.4  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0800  chaperone protein DnaJ  45.83 
 
 
378 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
387 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1630  silent information regulator protein Sir2  40.62 
 
 
244 aa  47.8  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071584  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  40.68 
 
 
378 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0565  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50 
 
 
220 aa  47.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1737  heat shock protein DnaJ domain protein  43.14 
 
 
241 aa  47.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.261222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3995  heat shock protein DnaJ domain protein  50.91 
 
 
96 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000305927 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5216  chaperone protein DnaJ  45.83 
 
 
404 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1019  heat shock protein DnaJ-like  26.84 
 
 
177 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  38 
 
 
331 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0231  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.07 
 
 
393 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208592  normal  0.303974 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  40.82 
 
 
307 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  36.36 
 
 
374 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>