More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2561 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2561  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 		 211 aa  443  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.747799 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4048  molecular chaperone DnaJ family  75 
 
 		 223 aa  335  3.9999999999999995e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292979  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3592  heat shock protein DnaJ domain protein  71.15 
 
 		 205 aa  315  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.329646  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3885  heat shock protein DnaJ domain protein  71.15 
 
 		 205 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3068  heat shock protein DnaJ-like  64.9 
 
 		 206 aa  274  8e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1947  DnaJ domain-containing protein  60.95 
 
 		 209 aa  268  5.9999999999999995e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.673449  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2024  DnaJ domain-containing protein  60.95 
 
 		 209 aa  268  5.9999999999999995e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0763655  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0913  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  59.52 
 
 		 209 aa  263  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0081  DnaJ domain-containing protein  54.29 
 
 		 206 aa  243  9.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5215  heat shock protein DnaJ domain protein  49.28 
 
 		 202 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.134163 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0496  heat shock protein DnaJ-like  45.41 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5127  molecular chaperone DnaJ family  48.57 
 
 		 202 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0401  heat shock protein DnaJ  44.7 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.337808 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6075  heat shock protein DnaJ domain protein  47.66 
 
 		 202 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0536  heat shock protein DnaJ-like  44.75 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.957898  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6495  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.87 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0284031  decreased coverage  0.00341928 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0319  heat shock protein DnaJ domain protein  42.93 
 
 		 199 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6015  heat shock protein DnaJ domain protein  46.48 
 
 		 201 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3697  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.33 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.700158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6741  heat shock protein DnaJ domain protein  43.66 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.450811  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.83 
 
 		 197 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884874  normal  0.323014 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3428  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.72 
 
 		 206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0501  heat shock protein DnaJ domain protein  43.38 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0539  heat shock protein DnaJ-like  42.27 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0290  heat shock protein DnaJ-like  42.27 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7569  hypothetical protein  45.36 
 
 		 189 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3555  heat shock protein DnaJ domain protein  39.5 
 
 		 235 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596429  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3231  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.15 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3426  heat shock protein DnaJ domain protein  38.4 
 
 		 237 aa  155  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1876  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  52.52 
 
 		 134 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2278  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35 
 
 		 204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.52692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.27 
 
 		 216 aa  122  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0205  heat shock protein DnaJ-like  40 
 
 		 203 aa  118  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1713  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.95 
 
 		 187 aa  111  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1874  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.32 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535727  normal  0.714616 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0117  heat shock protein DnaJ domain protein  32.76 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233042  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1861  heat shock protein DnaJ-like  33.33 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.921437  normal  0.0227918 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2910  heat shock protein DnaJ-like  33.33 
 
 		 196 aa  97.1  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294745  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3077  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.73 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2332  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.5 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0679914  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0688  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.21 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1978  DnaJ family molecular chaperone  30.21 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1202  heat shock protein DnaJ domain protein  30.61 
 
 		 209 aa  92.4  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.370648  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0645  heat shock protein DnaJ-like  30 
 
 		 208 aa  89.4  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147986  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0646  heat shock protein DnaJ-like protein  32.2 
 
 		 176 aa  85.9  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607248  normal  0.0426843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2948  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.41 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133197  normal  0.0175295 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  50.98 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  50.98 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.45 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  43.64 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1411  DnaJ family protein  45.45 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  46.3 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1748  heat shock protein DnaJ-like protein  29.38 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.405714  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  44.44 
 
 		 382 aa  58.9  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0974  chaperone DnaJ domain-containing protein  48.15 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583857 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  46.3 
 
 		 320 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  48.15 
 
 		 375 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  48.15 
 
 		 374 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0198  chaperone protein DnaJ  33.33 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0132968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0764  chaperone protein DnaJ  38.27 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252459  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0351  chaperone DnaJ domain protein  44.07 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.697421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  44.64 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 		 383 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  49.02 
 
 		 302 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  46.3 
 
 		 374 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3806  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.1 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  46.3 
 
 		 374 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0383  chaperone protein DnaJ  46.3 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  44.23 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  44.44 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0562  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.818243  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3619  chaperone DnaJ domain protein  44.44 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05510  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  42.37 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.731884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  45.1 
 
 		 384 aa  55.8  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0083  chaperone protein DnaJ  45.1 
 
 		 374 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  45.1 
 
 		 377 aa  55.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1255  chaperone protein DnaJ  44.44 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559961  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  43.14 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1019  heat shock protein DnaJ-like  27.32 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0723  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  48.15 
 
 		 377 aa  55.8  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  44.44 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6365  chaperone DnaJ domain protein  45.1 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0593575  normal  0.238878 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5358  predicted protein  46.3 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.653012  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  38.89 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6186  chaperone DnaJ domain protein  45.1 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.364765 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  45.1 
 
 		 386 aa  55.8  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  44.44 
 
 		 377 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  44.44 
 
 		 377 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1525  chaperone protein DnaJ  46.43 
 
 		 380 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  42.59 
 
 		 379 aa  55.5  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1988  chaperone protein DnaJ  47.06 
 
 		 379 aa  55.5  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.731806  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0629  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 		 393 aa  55.1  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  41.82 
 
 		 318 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  41.82 
 
 		 318 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5306  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.64 
 
 		 297 aa  55.1  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.764434 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  47.06 
 
 		 375 aa  55.1  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3900  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.06 
 
 		 313 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0934  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.62 
 
 		 320 aa  55.1  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0828376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>