127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1978 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1978  DnaJ family molecular chaperone  100 
 
 
211 aa  436  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0688  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
211 aa  436  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3077  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  96.68 
 
 
211 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1202  heat shock protein DnaJ domain protein  68.57 
 
 
209 aa  305  3e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.370648  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1861  heat shock protein DnaJ-like  63.03 
 
 
210 aa  283  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.921437  normal  0.0227918 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1874  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  63.98 
 
 
208 aa  282  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535727  normal  0.714616 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0645  heat shock protein DnaJ-like  59.05 
 
 
208 aa  268  4e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147986  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0496  heat shock protein DnaJ-like  37.43 
 
 
218 aa  112  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.01 
 
 
216 aa  112  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107685  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0401  heat shock protein DnaJ  38.42 
 
 
232 aa  111  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.337808 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0081  DnaJ domain-containing protein  32.86 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7569  hypothetical protein  36.87 
 
 
189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0536  heat shock protein DnaJ-like  37.22 
 
 
219 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.957898  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3068  heat shock protein DnaJ-like  33.33 
 
 
206 aa  105  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2910  heat shock protein DnaJ-like  35.42 
 
 
196 aa  105  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294745  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2278  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.16 
 
 
204 aa  105  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.52692  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1713  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.1 
 
 
187 aa  105  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0290  heat shock protein DnaJ-like  34.08 
 
 
215 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0539  heat shock protein DnaJ-like  34.64 
 
 
215 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0501  heat shock protein DnaJ domain protein  33.89 
 
 
214 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0205  heat shock protein DnaJ-like  31.67 
 
 
203 aa  99.4  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0913  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.88 
 
 
209 aa  99.8  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0117  heat shock protein DnaJ domain protein  33.95 
 
 
176 aa  97.4  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233042  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2332  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.82 
 
 
200 aa  96.7  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0679914  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3428  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.79 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4048  molecular chaperone DnaJ family  30.77 
 
 
223 aa  95.9  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292979  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2024  DnaJ domain-containing protein  31.89 
 
 
209 aa  94.7  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0763655  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1947  DnaJ domain-containing protein  31.89 
 
 
209 aa  94.7  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.673449  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3885  heat shock protein DnaJ domain protein  32.96 
 
 
205 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2561  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.21 
 
 
211 aa  94.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.747799 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.66 
 
 
197 aa  94.4  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884874  normal  0.323014 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0319  heat shock protein DnaJ domain protein  30.1 
 
 
199 aa  94.7  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3697  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.32 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6495  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.55 
 
 
206 aa  92  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0284031  decreased coverage  0.00341928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3592  heat shock protein DnaJ domain protein  31.32 
 
 
205 aa  92  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.329646  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6741  heat shock protein DnaJ domain protein  32.78 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.450811  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0646  heat shock protein DnaJ-like protein  31.82 
 
 
176 aa  87.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607248  normal  0.0426843 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3426  heat shock protein DnaJ domain protein  31.02 
 
 
237 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3555  heat shock protein DnaJ domain protein  30 
 
 
235 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596429  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3231  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30 
 
 
235 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6015  heat shock protein DnaJ domain protein  29.78 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6075  heat shock protein DnaJ domain protein  29.78 
 
 
202 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5215  heat shock protein DnaJ domain protein  27.49 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.134163 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5127  molecular chaperone DnaJ family  28.42 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1876  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.62 
 
 
134 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  40.68 
 
 
318 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5306  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.38 
 
 
297 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.764434 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  40.38 
 
 
372 aa  49.7  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0934  chaperone DnaJ domain-containing protein  46.15 
 
 
320 aa  48.9  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0828376 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.74 
 
 
320 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0787  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.07 
 
 
292 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.212048 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5216  chaperone protein DnaJ  44 
 
 
404 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5925  heat shock protein DnaJ domain protein  38.89 
 
 
279 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  37.29 
 
 
318 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  37.29 
 
 
318 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1019  heat shock protein DnaJ-like  26.71 
 
 
177 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  33.9 
 
 
383 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.38 
 
 
289 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.38 
 
 
287 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  36.84 
 
 
386 aa  45.4  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2948  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  23.84 
 
 
176 aa  45.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133197  normal  0.0175295 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0974  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.74 
 
 
316 aa  45.4  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.583857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7804  putative heat shock protein- DnaJ-like protein  37.25 
 
 
336 aa  45.1  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108723  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3908  chaperone DnaJ domain protein  36.84 
 
 
301 aa  45.1  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2209  chaperone DnaJ domain protein  37.74 
 
 
374 aa  45.1  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.990749  hitchhiker  0.0052734 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  32.2 
 
 
382 aa  44.3  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0546  DnaJ-like protein  29.58 
 
 
256 aa  44.3  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2992  chaperone DnaJ domain-containing protein  46.34 
 
 
306 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3573  chaperone protein DnaJ  34.48 
 
 
385 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.856531  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  34.92 
 
 
380 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0527  chaperone protein DnaJ  33.9 
 
 
396 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0800  chaperone protein DnaJ  40.38 
 
 
378 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  32.76 
 
 
377 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  30 
 
 
373 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  33.96 
 
 
374 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5358  predicted protein  36.21 
 
 
294 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.653012  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  32.86 
 
 
324 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  38.46 
 
 
388 aa  43.9  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  32.2 
 
 
376 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  33.96 
 
 
374 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6365  chaperone DnaJ domain protein  34.62 
 
 
304 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0593575  normal  0.238878 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  35.48 
 
 
340 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 
376 aa  43.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  36.54 
 
 
331 aa  43.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  31.03 
 
 
372 aa  43.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1748  heat shock protein DnaJ-like protein  41.3 
 
 
181 aa  43.5  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.405714  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3900  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.3 
 
 
313 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  38.46 
 
 
307 aa  43.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0009  chaperone protein DnaJ  33.9 
 
 
376 aa  42.7  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0447538  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0511  chaperone protein DnaJ  40.38 
 
 
378 aa  42.7  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.100964  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1264  heat shock protein DnaJ domain protein  37.74 
 
 
307 aa  42.7  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0110281  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  32.2 
 
 
379 aa  42.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3242  chaperone DnaJ  33.8 
 
 
378 aa  42.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6186  chaperone DnaJ domain protein  32.69 
 
 
304 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.364765 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0702  chaperone protein DnaJ  37.5 
 
 
379 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  37.04 
 
 
376 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0629  chaperone protein DnaJ  30.16 
 
 
393 aa  42  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  33.9 
 
 
382 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  37.04 
 
 
376 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  31.58 
 
 
333 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>