More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0546 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0546  DnaJ-like protein  100 
 
 		 256 aa  518  1e-146  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0977  DnaJ domain-containing protein  56.87 
 
 		 212 aa  238  5e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1034  DnaJ domain-containing protein  56.87 
 
 		 212 aa  237  1e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0627693  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0827  DnaJ domain-containing protein  56.4 
 
 		 212 aa  235  5.0000000000000005e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0668  DnaJ domain-containing protein  36.41 
 
 		 265 aa  136  4e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.165012  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1630  silent information regulator protein Sir2  36.76 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071584  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0397  heat shock protein DnaJ-like  29.41 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1837  DnaJ domain-containing protein  30 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0557  DnaJ domain-containing protein  34.67 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.223519  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2882  Dna-J like membrane chaperone protein  25.68 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450671  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2813  Dna-J like membrane chaperone protein  26.54 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603068  normal  0.639961 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1907  Dna-J like membrane chaperone protein  28.9 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0104  Dna-J like membrane chaperone protein  31.31 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000467525  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2075  Dna-J like membrane chaperone protein  31.31 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000570933  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0892  Dna-J like membrane chaperone protein  23.64 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4909  protein of unknown function DUF1332  28.72 
 
 		 245 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296192  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4522  Dna-J like membrane chaperone protein  25.11 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  25.24 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000026636  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0868  Dna-J like membrane chaperone protein  24.29 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0049  Dna-J like membrane chaperone protein  24.4 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000477601  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00059  Dna-J like membrane chaperone protein  24.76 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3544  heat shock protein DnaJ domain protein  24.4 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.15628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0061  Dna-J like membrane chaperone protein  24.4 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000128159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  24.4 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000613097  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0061  Dna-J like membrane chaperone protein  24.4 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000204638  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00058  hypothetical protein  24.76 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000167853  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3600  Dna-J like membrane chaperone protein  24.4 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000271898  hitchhiker  0.00000323028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3415  Dna-J like membrane chaperone protein  26.38 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.258634  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0728  Dna-J like membrane chaperone protein  23.67 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000304706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1055  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.18 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00001887  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4007  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  22.68 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0101  Dna-J like membrane chaperone protein  24.04 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000130204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0104  Dna-J like membrane chaperone protein  24.04 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141328  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0099  Dna-J like membrane chaperone protein  24.04 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0100  Dna-J like membrane chaperone protein  24.04 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000327368  normal  0.0501049 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0106  Dna-J like membrane chaperone protein  24.04 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000540131  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3633  Dna-J like membrane chaperone protein  23.89 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3203  Dna-J like membrane chaperone protein  23.45 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.967283 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0911  Dna-J like membrane chaperone protein  23.45 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0269993  normal  0.373919 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  24.87 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.2781  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0970  Dna-J like membrane chaperone protein  25.25 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0207673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0995  Dna-J like membrane chaperone protein  22.73 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.555246  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0207  DnaJ domain-containing protein  27.67 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4375  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.6 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.283206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0737  heat shock protein DnaJ domain protein  24.08 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3109  Dna-J like membrane chaperone protein  23.01 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03720  DnaJ domain containing protein  26.12 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.338466  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3440  Dna-J like membrane chaperone protein  22.63 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000544251  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0768  Dna-J like membrane chaperone protein  22.63 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128794  normal  0.0201885 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3569  Dna-J like membrane chaperone protein  22.63 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000771944  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0885  Dna-J like membrane chaperone protein  22.73 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00720639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001661  DnaJ-like protein DjlA  22.18 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2908  molecular chaperone DnaJ family  26.97 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0100  heat shock protein DnaJ-like protein  25.12 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3306  Dna-J like membrane chaperone protein  22.73 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.044478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0961  hypothetical protein  25.46 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.483965  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1085  Dna-J like membrane chaperone protein  22.73 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3073  Dna-J like membrane chaperone protein  24.55 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70305  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5129  heat shock protein DnaJ-like  21.76 
 
 		 255 aa  62  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.583171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0553  heat shock protein DnaJ domain protein  49.21 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1052  Dna-J like membrane chaperone protein  22.73 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0982922  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0983  Dna-J like membrane chaperone protein  22.73 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.193447  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2252  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  22.01 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4795  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  24.1 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0395  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  23.12 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.32724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1291  Dna-J like membrane chaperone protein  23.01 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  50.79 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2106  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  22.39 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1437  chaperone protein DnaJ  51.56 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0604  Dna-J like membrane chaperone protein  23.22 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000356276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1051  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.13 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2865  Dna-J like membrane chaperone protein  23.51 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787957  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1350  chaperone protein DnaJ  52.63 
 
 		 368 aa  59.3  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  42.25 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  54.39 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  42.25 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0345  heat shock protein DnaJ domain protein  43.28 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00881466 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1020  Dna-J like membrane chaperone protein  23.23 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.325317  normal  0.0319615 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1860  heat shock protein DnaJ-like  22.62 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1003  heat shock protein DnaJ domain protein  47.89 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00812  Dna-J like membrane chaperone protein  21.12 
 
 		 286 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3573  chaperone protein DnaJ  53.45 
 
 		 385 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.856531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.75 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0407  heat shock protein DnaJ domain protein  23.21 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  46.03 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  50.88 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03410  Dna-J like membrane chaperone protein  22.17 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2732  chaperone protein DnaJ  49.21 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000152871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.75 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  47.62 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0441  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  23.21 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2019  heat shock protein DnaJ-like  24 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.37079  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  52.63 
 
 		 382 aa  55.8  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3389  heat shock protein DnaJ-like  23.59 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  45.31 
 
 		 388 aa  55.8  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0049  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.83 
 
 		 339 aa  55.5  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1637  chaperone protein DnaJ  47.37 
 
 		 379 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.203531  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  40.85 
 
 		 340 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1731  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  23.3 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.94 
 
 		 319 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>