180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2332 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2332  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 		 200 aa  407  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0679914  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2910  heat shock protein DnaJ-like  55.67 
 
 		 196 aa  202  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294745  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0646  heat shock protein DnaJ-like protein  54.8 
 
 		 176 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607248  normal  0.0426843 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0539  heat shock protein DnaJ-like  36.76 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0501  heat shock protein DnaJ domain protein  37.63 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1861  heat shock protein DnaJ-like  32.68 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.921437  normal  0.0227918 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0290  heat shock protein DnaJ-like  36.76 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1713  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.98 
 
 		 187 aa  105  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0645  heat shock protein DnaJ-like  33.82 
 
 		 208 aa  104  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147986  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1202  heat shock protein DnaJ domain protein  32.84 
 
 		 209 aa  104  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.370648  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3697  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.63 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.700158 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0401  heat shock protein DnaJ  34.62 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.337808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7569  hypothetical protein  34.95 
 
 		 189 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0081  DnaJ domain-containing protein  31.94 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3077  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.83 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3555  heat shock protein DnaJ domain protein  37.11 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596429  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3428  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.78 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6741  heat shock protein DnaJ domain protein  38.12 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.450811  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1874  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.64 
 
 		 208 aa  98.6  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535727  normal  0.714616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3231  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.6 
 
 		 235 aa  98.2  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6495  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.36 
 
 		 206 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0284031  decreased coverage  0.00341928 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1978  DnaJ family molecular chaperone  31.82 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0688  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.82 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3426  heat shock protein DnaJ domain protein  36.84 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0536  heat shock protein DnaJ-like  31.89 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.957898  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0496  heat shock protein DnaJ-like  32.12 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2561  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.5 
 
 		 211 aa  94  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.747799 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0319  heat shock protein DnaJ domain protein  35.53 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2278  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.96 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.52692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3592  heat shock protein DnaJ domain protein  31.03 
 
 		 205 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.329646  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.23 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884874  normal  0.323014 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0117  heat shock protein DnaJ domain protein  33.72 
 
 		 176 aa  89  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233042  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_004310  BR2024  DnaJ domain-containing protein  32.28 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0763655  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3068  heat shock protein DnaJ-like  33.17 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1947  DnaJ domain-containing protein  32.28 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.673449  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3885  heat shock protein DnaJ domain protein  31.03 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4048  molecular chaperone DnaJ family  32.84 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292979  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0913  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.43 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.16 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0205  heat shock protein DnaJ-like  34.83 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5215  heat shock protein DnaJ domain protein  33.7 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.134163 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5127  molecular chaperone DnaJ family  32.39 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6075  heat shock protein DnaJ domain protein  29.83 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6015  heat shock protein DnaJ domain protein  29.83 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1876  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.47 
 
 		 134 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3619  chaperone DnaJ domain protein  45.45 
 
 		 326 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1019  heat shock protein DnaJ-like  27.93 
 
 		 177 aa  53.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  40 
 
 		 375 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0198  chaperone protein DnaJ  46 
 
 		 404 aa  49.3  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0132968  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  44 
 
 		 373 aa  48.1  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 		 374 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  38.89 
 
 		 371 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 		 374 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  39.22 
 
 		 380 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  40.82 
 
 		 311 aa  47.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0544  chaperone DnaJ domain protein  41.3 
 
 		 291 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  42.59 
 
 		 379 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04440  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  43.75 
 
 		 332 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.253974 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2999  chaperone protein DnaJ  42.59 
 
 		 395 aa  46.6  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.905644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3806  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.18 
 
 		 328 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03871  DnaJ3 protein  41.07 
 
 		 319 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.148184 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.86 
 
 		 324 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 		 377 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  38 
 
 		 376 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  38.89 
 
 		 382 aa  45.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.82 
 
 		 315 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2510  chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 		 376 aa  45.8  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1327  chaperone protein DnaJ  38 
 
 		 381 aa  45.4  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.869234  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1280  DnaJ domain protein  47.06 
 
 		 353 aa  45.4  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.22 
 
 		 316 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  40 
 
 		 377 aa  45.1  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06170  DnaJ domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08300)  42 
 
 		 418 aa  45.1  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.281227 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0629  chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 		 393 aa  45.1  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  36 
 
 		 376 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  35.19 
 
 		 379 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  35.19 
 
 		 379 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  35.19 
 
 		 379 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4095  chaperone protein DnaJ  37.25 
 
 		 376 aa  44.7  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  35.19 
 
 		 379 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  35.19 
 
 		 379 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  35.19 
 
 		 373 aa  44.7  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4415  chaperone protein DnaJ  37.25 
 
 		 375 aa  44.7  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0982  chaperone DnaJ domain protein  35.19 
 
 		 294 aa  44.7  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  42.86 
 
 		 325 aa  44.7  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1011  chaperone DnaJ domain protein  35.19 
 
 		 294 aa  44.7  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  38.78 
 
 		 296 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0958  chaperone protein DnaJ  37.04 
 
 		 377 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0996  chaperone protein DnaJ  37.04 
 
 		 377 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.406882 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0960  chaperone protein DnaJ  37.04 
 
 		 377 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0112522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  42 
 
 		 387 aa  44.3  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  36 
 
 		 376 aa  44.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  36 
 
 		 376 aa  44.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3410  chaperone protein DnaJ  35.19 
 
 		 377 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129468  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4473  chaperone protein DnaJ  37.04 
 
 		 376 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.264667  normal  0.173386 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1148  chaperone protein DnaJ  36.73 
 
 		 359 aa  44.7  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.697031  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3573  chaperone protein DnaJ  38 
 
 		 385 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.856531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  36 
 
 		 376 aa  44.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  36 
 
 		 376 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1630  silent information regulator protein Sir2  42.62 
 
 		 244 aa  43.9  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071584  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1043  chaperone protein DnaJ  35.19 
 
 		 377 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0054277  decreased coverage  0.0000000510426 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>