More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0205 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0205  heat shock protein DnaJ-like  100 
 
 
203 aa  417  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1713  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.15 
 
 
187 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.88 
 
 
197 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884874  normal  0.323014 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0117  heat shock protein DnaJ domain protein  43.03 
 
 
176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233042  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0290  heat shock protein DnaJ-like  37.7 
 
 
215 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0539  heat shock protein DnaJ-like  37.02 
 
 
215 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3697  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.57 
 
 
208 aa  122  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0501  heat shock protein DnaJ domain protein  35.68 
 
 
214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2561  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40 
 
 
211 aa  118  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.747799 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1874  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.01 
 
 
208 aa  118  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535727  normal  0.714616 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6741  heat shock protein DnaJ domain protein  35.63 
 
 
206 aa  118  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.450811  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3885  heat shock protein DnaJ domain protein  36.7 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3592  heat shock protein DnaJ domain protein  37.23 
 
 
205 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.329646  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0913  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.27 
 
 
209 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0536  heat shock protein DnaJ-like  35.87 
 
 
219 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.957898  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6495  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.06 
 
 
206 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0284031  decreased coverage  0.00341928 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3428  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.88 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0496  heat shock protein DnaJ-like  34.81 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4048  molecular chaperone DnaJ family  33.83 
 
 
223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292979  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3068  heat shock protein DnaJ-like  38.33 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7569  hypothetical protein  35.36 
 
 
189 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2024  DnaJ domain-containing protein  36.76 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0763655  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1947  DnaJ domain-containing protein  36.76 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.673449  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3555  heat shock protein DnaJ domain protein  35.68 
 
 
235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596429  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3426  heat shock protein DnaJ domain protein  35.91 
 
 
237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0401  heat shock protein DnaJ  34.78 
 
 
232 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.337808 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3231  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.14 
 
 
235 aa  108  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3077  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.78 
 
 
211 aa  104  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.76 
 
 
216 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107685  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1861  heat shock protein DnaJ-like  34.07 
 
 
210 aa  102  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.921437  normal  0.0227918 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0319  heat shock protein DnaJ domain protein  36.57 
 
 
199 aa  101  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0645  heat shock protein DnaJ-like  35.47 
 
 
208 aa  101  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147986  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1202  heat shock protein DnaJ domain protein  30.73 
 
 
209 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.370648  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0688  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.67 
 
 
211 aa  99.4  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1978  DnaJ family molecular chaperone  31.67 
 
 
211 aa  99.4  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0081  DnaJ domain-containing protein  31.18 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2278  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.94 
 
 
204 aa  96.7  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.52692  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2332  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.83 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0679914  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5215  heat shock protein DnaJ domain protein  31.82 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.134163 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2910  heat shock protein DnaJ-like  31.43 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294745  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0646  heat shock protein DnaJ-like protein  31.21 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607248  normal  0.0426843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1876  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.35 
 
 
134 aa  67.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5127  molecular chaperone DnaJ family  28.21 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2948  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.65 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133197  normal  0.0175295 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6015  heat shock protein DnaJ domain protein  29.44 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6075  heat shock protein DnaJ domain protein  29.44 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1019  heat shock protein DnaJ-like  27.72 
 
 
177 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  50 
 
 
318 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4013  chaperone DnaJ-like  41.51 
 
 
333 aa  55.1  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.183455  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1748  heat shock protein DnaJ-like protein  24.42 
 
 
181 aa  55.1  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.405714  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1520  heat shock protein DnaJ domain protein  45.28 
 
 
228 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1616  chaperone protein DnaJ  45.1 
 
 
352 aa  55.1  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.214383 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0493  chaperone protein DnaJ  45.1 
 
 
373 aa  54.3  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0198  chaperone protein DnaJ  44.23 
 
 
404 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0132968  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  46 
 
 
307 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  46.15 
 
 
387 aa  54.3  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  46.15 
 
 
380 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1396  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 
373 aa  53.5  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.427983  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  48.98 
 
 
383 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3573  chaperone protein DnaJ  51.02 
 
 
385 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.856531  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  51.02 
 
 
297 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  51.02 
 
 
297 aa  53.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0465  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 
374 aa  53.1  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141639  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  44.9 
 
 
333 aa  52.4  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0854  chaperone protein DnaJ  49.02 
 
 
395 aa  52.4  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000496587  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1276  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 
374 aa  52.4  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00131629  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  42.31 
 
 
373 aa  52.4  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  46.94 
 
 
386 aa  52.4  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1607  chaperone protein DnaJ  44.9 
 
 
355 aa  51.6  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.231275  normal  0.231372 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  44.44 
 
 
330 aa  51.6  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  46.94 
 
 
384 aa  51.6  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1208  heat shock protein DnaJ domain protein  44.9 
 
 
134 aa  51.2  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  50.98 
 
 
375 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0965  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
380 aa  51.2  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0652035  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1829  heat shock protein DnaJ-like  43.14 
 
 
318 aa  51.2  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  44.23 
 
 
299 aa  51.2  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  48.98 
 
 
388 aa  51.2  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  46.94 
 
 
372 aa  51.2  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  50.98 
 
 
374 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  56.41 
 
 
382 aa  51.2  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  49.02 
 
 
375 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  48.98 
 
 
387 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  48.98 
 
 
387 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1872  chaperone protein DnaJ  50.98 
 
 
395 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000340868  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1411  DnaJ family protein  45.1 
 
 
330 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  53.85 
 
 
315 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0629  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 
393 aa  50.1  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  44 
 
 
324 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1148  chaperone protein DnaJ  53.66 
 
 
359 aa  50.1  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.697031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  43.14 
 
 
333 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  53.85 
 
 
311 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0971  chaperone protein DnaJ  47.06 
 
 
359 aa  50.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0013  chaperone DnaJ domain-containing protein  46 
 
 
302 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000027802  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1691  chaperone protein DnaJ  49.02 
 
 
401 aa  49.7  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.211452  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1299  chaperone protein DnaJ  44 
 
 
371 aa  49.3  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0562  chaperone protein DnaJ  46.94 
 
 
376 aa  49.7  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.818243  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  46 
 
 
316 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  49.02 
 
 
374 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  49.02 
 
 
374 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1088  chaperone protein DnaJ  49.02 
 
 
394 aa  49.3  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.038983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>