More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2948 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2948  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
176 aa  356  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133197  normal  0.0175295 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1748  heat shock protein DnaJ-like protein  67.06 
 
 
181 aa  217  7.999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.405714  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1019  heat shock protein DnaJ-like  62.64 
 
 
177 aa  201  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0645  heat shock protein DnaJ-like  28.87 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147986  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3885  heat shock protein DnaJ domain protein  28.57 
 
 
205 aa  72  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0081  DnaJ domain-containing protein  27.37 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1861  heat shock protein DnaJ-like  30.41 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.921437  normal  0.0227918 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2561  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.41 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.747799 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3592  heat shock protein DnaJ domain protein  28.57 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.329646  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1874  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.18 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535727  normal  0.714616 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4048  molecular chaperone DnaJ family  28.18 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292979  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1202  heat shock protein DnaJ domain protein  28.72 
 
 
209 aa  68.2  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.370648  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2278  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.78 
 
 
204 aa  67.8  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.52692  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2024  DnaJ domain-containing protein  27.47 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0763655  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1947  DnaJ domain-containing protein  27.47 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.673449  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0205  heat shock protein DnaJ-like  28.65 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0539  heat shock protein DnaJ-like  26.49 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7569  hypothetical protein  28.49 
 
 
189 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0536  heat shock protein DnaJ-like  26.78 
 
 
219 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.957898  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0319  heat shock protein DnaJ domain protein  31.55 
 
 
199 aa  63.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0913  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.47 
 
 
209 aa  63.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0290  heat shock protein DnaJ-like  25.41 
 
 
215 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.99 
 
 
216 aa  61.2  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107685  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3068  heat shock protein DnaJ-like  27.84 
 
 
206 aa  60.8  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0501  heat shock protein DnaJ domain protein  25 
 
 
214 aa  60.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0192  chaperone protein DnaJ  50.88 
 
 
375 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1713  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.12 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0496  heat shock protein DnaJ-like  25.28 
 
 
218 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0506  heat shock protein DnaJ-like  48.28 
 
 
330 aa  58.2  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366766  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1829  heat shock protein DnaJ-like  44.83 
 
 
318 aa  57.8  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6495  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.04 
 
 
206 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0284031  decreased coverage  0.00341928 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0430  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 
379 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0390  chaperone protein DnaJ  45.61 
 
 
386 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3428  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.03 
 
 
206 aa  55.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1208  heat shock protein DnaJ domain protein  39.34 
 
 
134 aa  55.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  50 
 
 
320 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  45.61 
 
 
382 aa  55.1  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2910  heat shock protein DnaJ-like  27.12 
 
 
196 aa  55.1  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294745  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6741  heat shock protein DnaJ domain protein  27.53 
 
 
206 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.450811  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00251  DnaJ domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03520)  39.34 
 
 
641 aa  55.1  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.93 
 
 
197 aa  54.3  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884874  normal  0.323014 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5306  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.1 
 
 
297 aa  54.7  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.764434 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  43.1 
 
 
337 aa  54.3  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1396  chaperone protein DnaJ  40.98 
 
 
373 aa  53.9  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.427983  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0493  chaperone protein DnaJ  40.98 
 
 
373 aa  53.5  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0337  chaperone protein DnaJ  42.11 
 
 
379 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0200534  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3908  chaperone DnaJ domain protein  43.1 
 
 
301 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03871  DnaJ3 protein  43.86 
 
 
319 aa  53.9  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.148184 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0156  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 
377 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0465  chaperone protein DnaJ  40.98 
 
 
374 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141639  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0198  chaperone protein DnaJ  42.11 
 
 
378 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05510  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  45.61 
 
 
361 aa  53.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.731884  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  42.11 
 
 
377 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1972  chaperone protein DnaJ  46.55 
 
 
375 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000781589 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 
386 aa  53.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1276  chaperone protein DnaJ  40.98 
 
 
374 aa  53.5  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00131629  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0401  heat shock protein DnaJ  25.82 
 
 
232 aa  52.4  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.337808 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1286  chaperone DnaJ  40 
 
 
373 aa  52.4  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0330  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 
379 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  42.11 
 
 
333 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  43.1 
 
 
311 aa  52.4  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 
379 aa  52  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2235  chaperone protein DnaJ  44.83 
 
 
375 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0177525  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.1 
 
 
324 aa  52  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6365  chaperone DnaJ domain protein  40.35 
 
 
304 aa  51.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0593575  normal  0.238878 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1520  heat shock protein DnaJ domain protein  47.06 
 
 
228 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1249  chaperone protein DnaJ  42.11 
 
 
380 aa  51.6  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38744  normal  0.199724 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1382  heat shock protein DnaJ domain protein  43.1 
 
 
297 aa  51.6  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.995337  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1134  chaperone protein DnaJ  39.34 
 
 
362 aa  51.6  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3220  chaperone protein DnaJ  38.6 
 
 
374 aa  51.6  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000114884  hitchhiker  0.0000204508 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38560  chaperone protein DnaJ  41.38 
 
 
387 aa  51.2  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0413563  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4013  chaperone DnaJ-like  35.09 
 
 
333 aa  51.2  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.183455  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1411  DnaJ family protein  38.71 
 
 
330 aa  51.2  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  44.83 
 
 
375 aa  51.2  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1972  chaperone protein DnaJ  39.34 
 
 
374 aa  51.2  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  40.35 
 
 
333 aa  50.8  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  43.1 
 
 
385 aa  50.8  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  43.1 
 
 
325 aa  50.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6947  chaperone protein DnaJ  43.64 
 
 
398 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.11 
 
 
315 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  37.1 
 
 
330 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6186  chaperone DnaJ domain protein  38.6 
 
 
304 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.364765 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02351  DnaJ-like molecular chaperone  39.66 
 
 
312 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2053  chaperone protein DnaJ  39.34 
 
 
378 aa  50.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.519265  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4805  chaperone protein DnaJ  47.46 
 
 
406 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  41.38 
 
 
388 aa  50.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5061  chaperone DnaJ domain protein  36.21 
 
 
303 aa  50.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2992  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.11 
 
 
306 aa  50.4  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0974  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.66 
 
 
316 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.583857 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  38.6 
 
 
375 aa  49.7  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6075  heat shock protein DnaJ domain protein  25 
 
 
202 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3756  chaperone DnaJ domain protein  38.6 
 
 
303 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144463  normal  0.652228 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0544  chaperone DnaJ domain protein  37.93 
 
 
291 aa  50.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  43.1 
 
 
318 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 
377 aa  49.7  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  43.1 
 
 
318 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  45.61 
 
 
381 aa  50.1  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.48 
 
 
330 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0985  heat shock protein DnaJ domain protein  47.06 
 
 
334 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.564303  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1904  chaperone protein DnaJ  45.61 
 
 
391 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>