More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0117 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0117  heat shock protein DnaJ domain protein  100 
 
 
176 aa  359  1e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233042  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1713  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  52.38 
 
 
187 aa  174  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0205  heat shock protein DnaJ-like  43.86 
 
 
203 aa  134  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0501  heat shock protein DnaJ domain protein  39.33 
 
 
214 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0290  heat shock protein DnaJ-like  38.29 
 
 
215 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0539  heat shock protein DnaJ-like  37.71 
 
 
215 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40 
 
 
197 aa  121  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884874  normal  0.323014 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3428  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.77 
 
 
206 aa  118  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0496  heat shock protein DnaJ-like  35.75 
 
 
218 aa  117  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0536  heat shock protein DnaJ-like  38.64 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.957898  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0319  heat shock protein DnaJ domain protein  40.85 
 
 
199 aa  115  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3592  heat shock protein DnaJ domain protein  32.18 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.329646  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7569  hypothetical protein  35.84 
 
 
189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4048  molecular chaperone DnaJ family  32.95 
 
 
223 aa  111  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292979  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6741  heat shock protein DnaJ domain protein  36.63 
 
 
206 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.450811  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3885  heat shock protein DnaJ domain protein  31.4 
 
 
205 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0401  heat shock protein DnaJ  33.9 
 
 
232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.337808 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1947  DnaJ domain-containing protein  34.29 
 
 
209 aa  108  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.673449  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2024  DnaJ domain-containing protein  34.29 
 
 
209 aa  108  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0763655  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0913  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.29 
 
 
209 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3697  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.26 
 
 
208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700158 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2561  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.37 
 
 
211 aa  107  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.747799 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3077  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.97 
 
 
211 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3426  heat shock protein DnaJ domain protein  36.07 
 
 
237 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3068  heat shock protein DnaJ-like  35.26 
 
 
206 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0081  DnaJ domain-containing protein  33.14 
 
 
206 aa  105  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6495  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.5 
 
 
206 aa  105  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0284031  decreased coverage  0.00341928 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1874  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.54 
 
 
208 aa  104  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535727  normal  0.714616 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1978  DnaJ family molecular chaperone  33.95 
 
 
211 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0688  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.95 
 
 
211 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0645  heat shock protein DnaJ-like  32.92 
 
 
208 aa  102  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147986  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3555  heat shock protein DnaJ domain protein  32.42 
 
 
235 aa  102  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596429  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3231  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.42 
 
 
235 aa  101  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.33 
 
 
216 aa  101  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107685  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1202  heat shock protein DnaJ domain protein  33.74 
 
 
209 aa  97.8  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.370648  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1861  heat shock protein DnaJ-like  32.93 
 
 
210 aa  95.5  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.921437  normal  0.0227918 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2278  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.65 
 
 
204 aa  89.7  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.52692  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2332  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.21 
 
 
200 aa  89  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0679914  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2910  heat shock protein DnaJ-like  34.88 
 
 
196 aa  87  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294745  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0646  heat shock protein DnaJ-like protein  36.87 
 
 
176 aa  84.3  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607248  normal  0.0426843 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5215  heat shock protein DnaJ domain protein  31.79 
 
 
202 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.134163 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6075  heat shock protein DnaJ domain protein  30.18 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6015  heat shock protein DnaJ domain protein  30.18 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1876  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.82 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5127  molecular chaperone DnaJ family  28.49 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3573  chaperone protein DnaJ  52.94 
 
 
385 aa  59.7  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.856531  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  48.21 
 
 
297 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  48.21 
 
 
297 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  53.06 
 
 
373 aa  55.5  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  50 
 
 
330 aa  55.5  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1411  DnaJ family protein  52 
 
 
330 aa  54.7  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0971  chaperone protein DnaJ  53.06 
 
 
359 aa  53.9  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0739  chaperone protein DnaJ  51.02 
 
 
355 aa  53.9  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0854  chaperone protein DnaJ  48 
 
 
395 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000496587  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  51.02 
 
 
318 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  52.08 
 
 
380 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0013  chaperone DnaJ domain-containing protein  48.98 
 
 
302 aa  53.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000027802  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  50 
 
 
330 aa  53.1  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1607  chaperone protein DnaJ  46.43 
 
 
355 aa  52.8  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.231275  normal  0.231372 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  46 
 
 
386 aa  52.4  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  45.83 
 
 
307 aa  52.4  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  51.02 
 
 
326 aa  52.4  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0114  chaperone protein DnaJ  52.08 
 
 
391 aa  52.4  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000234642 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  51.02 
 
 
387 aa  52.4  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1616  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
352 aa  52.8  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.214383 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  48.98 
 
 
383 aa  52  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 
387 aa  52  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 
387 aa  52  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  51.02 
 
 
316 aa  52  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
372 aa  51.6  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  42.19 
 
 
382 aa  51.2  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1856  chaperone DnaJ domain protein  47.06 
 
 
328 aa  51.2  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000127856  normal  0.0651455 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0629  chaperone protein DnaJ  42.37 
 
 
393 aa  51.2  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  51.02 
 
 
324 aa  51.2  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0115  chaperone protein DnaJ  52.08 
 
 
390 aa  50.8  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0040  chaperone protein DnaJ  48 
 
 
372 aa  50.4  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2961  chaperone protein DnaJ  46 
 
 
385 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.271615 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3187  chaperone protein DnaJ  46 
 
 
385 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.117357 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0800  chaperone protein DnaJ  47.92 
 
 
378 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4013  chaperone DnaJ-like  56.1 
 
 
333 aa  50.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.183455  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  50 
 
 
337 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1148  chaperone protein DnaJ  46 
 
 
359 aa  50.4  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.697031  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3143  chaperone protein DnaJ  46 
 
 
383 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  46 
 
 
334 aa  50.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2674  chaperone DnaJ domain protein  48.98 
 
 
309 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  53.06 
 
 
294 aa  49.7  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0198  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
404 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0132968  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1645  chaperone protein DnaJ  48.98 
 
 
383 aa  49.7  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0266103  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  54.17 
 
 
315 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0976  co-chaperone protein DnaJ  48.15 
 
 
295 aa  50.1  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.984114  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
380 aa  50.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  46 
 
 
379 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  44.07 
 
 
375 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  50 
 
 
311 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02351  DnaJ-like molecular chaperone  39.29 
 
 
312 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1437  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 
379 aa  50.1  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5358  predicted protein  41.82 
 
 
294 aa  49.7  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.653012  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  42 
 
 
318 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0675  heat shock protein  44.23 
 
 
276 aa  49.3  0.00003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.745295  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0535  chaperone protein DnaJ  38.98 
 
 
379 aa  49.3  0.00003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>