87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1933 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1933  heat shock protein DnaJ-like  100 
 
 
97 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0426036  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1763  dnaJ domain-containing protein  75.26 
 
 
96 aa  156  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0456509  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2174  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  67.71 
 
 
96 aa  135  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4075  heat shock protein DnaJ domain protein  66.32 
 
 
96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3995  heat shock protein DnaJ domain protein  63.54 
 
 
96 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000305927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3911  heat shock protein DnaJ domain protein  60.42 
 
 
96 aa  118  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000487645  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1959  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  55.67 
 
 
105 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0510  chaperone DnaJ domain-containing protein  52.58 
 
 
97 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2181  heat shock protein DnaJ domain protein  46.46 
 
 
102 aa  90.5  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00441328  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1230  heat shock protein DnaJ-like  36.14 
 
 
90 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1895  heat shock protein DnaJ domain protein  38.75 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15290  heat shock protein DnaJ domain protein  30.11 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00372655  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0257  heat shock protein DnaJ-like  30.21 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.476509  normal  0.365369 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  49.09 
 
 
197 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884874  normal  0.323014 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0725  putative DnaJ-related protein  42.59 
 
 
205 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0880  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.33 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0445243  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3592  heat shock protein DnaJ domain protein  41.82 
 
 
205 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.329646  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1002  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.67 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0913  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.86 
 
 
209 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3885  heat shock protein DnaJ domain protein  41.07 
 
 
205 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1713  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.86 
 
 
187 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4048  molecular chaperone DnaJ family  39.29 
 
 
223 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292979  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3068  heat shock protein DnaJ-like  42.86 
 
 
206 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1630  silent information regulator protein Sir2  39.34 
 
 
244 aa  47.4  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071584  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2561  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.29 
 
 
211 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.747799 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0023  chaperone protein DnaJ  37.84 
 
 
384 aa  47.4  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1088  heat shock protein DnaJ-like  50.98 
 
 
258 aa  47.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0117  heat shock protein DnaJ domain protein  36.51 
 
 
176 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233042  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1947  DnaJ domain-containing protein  42.86 
 
 
209 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.673449  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0546  DnaJ-like protein  35.29 
 
 
256 aa  46.6  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2024  DnaJ domain-containing protein  42.86 
 
 
209 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0763655  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0668  DnaJ domain-containing protein  38.98 
 
 
265 aa  45.8  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.165012  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0205  heat shock protein DnaJ-like  38.89 
 
 
203 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0018  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
388 aa  45.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.253679  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26301  putative heat shock protein DnaJ  40.82 
 
 
232 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0687  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.44 
 
 
219 aa  44.3  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365833 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3029  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  33.85 
 
 
357 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38015  predicted protein  36.21 
 
 
398 aa  43.9  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.964635  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2507  heat shock protein DnaJ-like  44.9 
 
 
235 aa  43.5  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00174132  normal  0.410211 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1837  DnaJ domain-containing protein  43.59 
 
 
264 aa  42.7  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  35.94 
 
 
356 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01371  putative heat shock protein DnaJ  33.33 
 
 
232 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.333222 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0942  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.31 
 
 
377 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.122373  normal  0.06017 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1751  chaperone protein DnaJ  36.21 
 
 
374 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  32.86 
 
 
359 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2348  chaperone protein DnaJ  32.76 
 
 
380 aa  42.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.576372  normal  0.374369 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0765  co-chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
290 aa  42.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000175229  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1503  heat shock protein DnaJ domain protein  38.78 
 
 
233 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000293198 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0081  DnaJ domain-containing protein  33.93 
 
 
206 aa  42.4  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf297  heat shock protein DnaJ  29.31 
 
 
369 aa  41.6  0.003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.302595  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  29.87 
 
 
356 aa  41.6  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1980  chaperone protein DnaJ  35.59 
 
 
378 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl414  chaperone protein DnaJ  36.73 
 
 
374 aa  42  0.003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0976  heat shock protein DnaJ-like  45.1 
 
 
256 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.156674  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1243  co-chaperone protein DnaJ  39.22 
 
 
297 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00000103422  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1060  chaperone protein DnaJ  35.29 
 
 
380 aa  41.6  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00149105  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0379  chaperone protein DnaJ  36.21 
 
 
376 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0496  co-chaperone protein DnaJ  39.22 
 
 
294 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0272184  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1208  chaperone protein DnaJ  33.33 
 
 
373 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.827822  hitchhiker  0.00896971 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1876  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.82 
 
 
134 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1364  co-chaperone protein DnaJ  39.22 
 
 
297 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl299  heat shock protein chaperone  34 
 
 
218 aa  41.2  0.004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  6.65204e-51  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2364  heat shock protein DnaJ-like  39.58 
 
 
222 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.719019  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0778  co-chaperone-curved DNA binding protein A  39.22 
 
 
288 aa  41.6  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0536  heat shock protein DnaJ-like  40 
 
 
219 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.957898  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0928  heat shock protein DnaJ domain protein  36.21 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0729637  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0723  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.25 
 
 
326 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1147  chaperone protein DnaJ  31.43 
 
 
373 aa  41.2  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0018  DnaJ domain protein  35.59 
 
 
292 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0805  protein translation intiation inhibitor  31.43 
 
 
296 aa  41.2  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000779647  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  37.93 
 
 
375 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  29.89 
 
 
330 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  37.25 
 
 
336 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0539  heat shock protein DnaJ-like  40 
 
 
215 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0976  co-chaperone protein DnaJ  31.43 
 
 
295 aa  40.8  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.984114  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1065  DnaJ domain-containing protein  30 
 
 
298 aa  40.4  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000172  DnaJ-related protein  40.74 
 
 
206 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1637  chaperone protein DnaJ  32.26 
 
 
379 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.203531  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1671  chaperone protein DnaJ  32.26 
 
 
379 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  35.59 
 
 
384 aa  40.4  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  30.77 
 
 
307 aa  40  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7569  hypothetical protein  37.78 
 
 
189 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0553  heat shock protein DnaJ domain protein  29.23 
 
 
255 aa  40.4  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3070  chaperone DnaJ domain protein  37.25 
 
 
315 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0501  heat shock protein DnaJ domain protein  38.18 
 
 
214 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1124  heat shock protein DnaJ domain protein  37.25 
 
 
326 aa  40  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.405615 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3860  curved DNA-binding protein CbpA  38 
 
 
309 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.167572  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>