26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3029 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3029  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  100 
 
 
357 aa  723    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0698  hypothetical protein  25 
 
 
343 aa  113  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2832  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.82 
 
 
324 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2834  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.51 
 
 
249 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1809  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.7 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.835829  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1807  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1808  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.62 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.580439  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2401  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.2 
 
 
279 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0700  hypothetical protein  21.4 
 
 
259 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3028  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.48 
 
 
250 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2355  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.54 
 
 
243 aa  59.7  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4011  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.82 
 
 
441 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.923293  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1258  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.4 
 
 
268 aa  47  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.811139 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3262  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.37 
 
 
254 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3578  putative gas vesicle synthesis protein  21.37 
 
 
254 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0073  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.11 
 
 
244 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.177784  hitchhiker  0.00184802 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2826  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.79 
 
 
249 aa  46.2  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1987  heat shock protein DnaJ domain protein  36.84 
 
 
424 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.657228 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0510  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.33 
 
 
97 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1491  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.66 
 
 
261 aa  44.3  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0699  hypothetical protein  22.22 
 
 
260 aa  44.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  42.31 
 
 
302 aa  43.9  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1933  heat shock protein DnaJ-like  33.85 
 
 
97 aa  43.9  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0426036  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15290  heat shock protein DnaJ domain protein  35.8 
 
 
107 aa  43.5  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00372655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1763  dnaJ domain-containing protein  37.5 
 
 
96 aa  43.5  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0456509  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4075  heat shock protein DnaJ domain protein  33.33 
 
 
96 aa  42.7  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>