79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1809 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1809  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  100 
 
 		 339 aa  680    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.835829  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0698  hypothetical protein  36.42 
 
 		 343 aa  238  8e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2832  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  29.59 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2401  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.13 
 
 		 279 aa  102  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3029  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.7 
 
 		 357 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0700  hypothetical protein  29.13 
 
 		 259 aa  90.9  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2834  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.91 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1807  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  29.02 
 
 		 258 aa  82.4  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1808  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.05 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.580439  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3028  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.32 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1491  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.79 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0073  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.69 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.177784  hitchhiker  0.00184802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6856  hypothetical protein  21.12 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3383  gas vesicle synthesis GvpLF  20 
 
 		 270 aa  57  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2409  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.62 
 
 		 259 aa  57  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2339  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.85 
 
 		 266 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0186658 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0699  hypothetical protein  23.48 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4705  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  18.85 
 
 		 256 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2826  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.34 
 
 		 249 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2355  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.66 
 
 		 243 aa  50.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31237  predicted protein  41.07 
 
 		 142 aa  49.7  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.652624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2014  chaperone DnaJ-like  50.98 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122637  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2553  chaperone DnaJ domain protein  45.28 
 
 		 309 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.373438  normal  0.0279276 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl438  heat shock protein chaperone  43.86 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043812  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2928  chaperone protein DnaJ  47.17 
 
 		 375 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3191  chaperone protein DnaJ  47.17 
 
 		 375 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06170  DnaJ domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08300)  45.1 
 
 		 418 aa  47  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.281227 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 		 359 aa  47  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0764  chaperone protein DnaJ  43.64 
 
 		 397 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252459  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2382  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  18.15 
 
 		 264 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18096  predicted protein  45.1 
 
 		 353 aa  46.6  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2335  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  18.15 
 
 		 264 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90915  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2376  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  18.15 
 
 		 264 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0703  hypothetical protein  24.54 
 
 		 262 aa  46.6  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  43.14 
 
 		 356 aa  46.2  0.0009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  45.1 
 
 		 356 aa  46.2  0.0009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1070  heat shock protein DnaJ domain protein  44 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709759  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1804  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  47.92 
 
 		 266 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.315624  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04192  DnaJ and TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G05900)  43.75 
 
 		 634 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.107548  normal  0.45593 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  41.82 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  49.02 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  41.82 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2303  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0682598  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0823  chaperone protein DnaJ  46 
 
 		 388 aa  44.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4504  dnaJ protein  41.82 
 
 		 380 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4194  chaperone protein DnaJ  41.82 
 
 		 380 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.993015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  41.82 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  41.82 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5524  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  48 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0675  heat shock protein  45.31 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.745295  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85654  yeast dnaJ homolog (nuclear envelope protein) heat shock protein  46 
 
 		 404 aa  44.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.351399  normal  0.0803186 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  47.06 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1015  putative DnaJ-like protein  40 
 
 		 235 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232085  normal  0.105814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  45.28 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1443  DNAJ class chaperone; heat shock protein  47.06 
 
 		 402 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1647  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 		 379 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51193  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  40 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  45.1 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0629  chaperone protein DnaJ  45.28 
 
 		 393 aa  44.7  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18036  predicted protein  35.53 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  40 
 
 		 374 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2102  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44 
 
 		 312 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0238412 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1825  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 		 377 aa  44.3  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  42 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  45.1 
 
 		 376 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0023  chaperone protein DnaJ  45.1 
 
 		 384 aa  43.5  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_8469  predicted protein  46 
 
 		 61 aa  43.5  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182467  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1988  chaperone protein DnaJ  39.62 
 
 		 379 aa  43.5  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.731806  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.1 
 
 		 287 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.1 
 
 		 289 aa  43.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3228  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.94 
 
 		 93 aa  43.1  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.862412  normal  0.903575 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0707  chaperone protein DnaJ  48 
 
 		 383 aa  42.7  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000115136  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01120  chaperone regulator, putative  42.31 
 
 		 361 aa  42.7  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3162  chaperone DnaJ domain protein  42 
 
 		 387 aa  42.7  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.354519  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0212  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 		 372 aa  42.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.321042  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  45.1 
 
 		 380 aa  42.7  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0854  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 		 395 aa  42.7  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000496587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 		 389 aa  42.7  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  37.25 
 
 		 375 aa  42.7  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>