28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2382 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2335  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  100 
 
 		 264 aa  521  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2382  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  100 
 
 		 264 aa  521  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2376  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  100 
 
 		 264 aa  521  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6856  hypothetical protein  53.17 
 
 		 270 aa  262  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3383  gas vesicle synthesis GvpLF  53.94 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4705  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  43.57 
 
 		 256 aa  204  9e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2401  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.5 
 
 		 279 aa  95.5  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2355  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  30.68 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3028  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.32 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0700  hypothetical protein  24.1 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1807  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.66 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1808  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.67 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.580439  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2834  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.85 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0073  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.31 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.177784  hitchhiker  0.00184802 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1491  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.4 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1258  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.35 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.811139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4007  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  30 
 
 		 289 aa  62  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1007  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  29.77 
 
 		 272 aa  62  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0338  GvpL  25.28 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0699  hypothetical protein  23.69 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1248  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.59 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2832  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.98 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1486  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.96 
 
 		 368 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1802  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.82 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2339  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.31 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0186658 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0073  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25 
 
 		 344 aa  49.7  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.494868  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0213  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  28 
 
 		 300 aa  45.4  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2367  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.32 
 
 		 316 aa  42  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>