37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1248 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1248  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  100 
 
 		 270 aa  558  1e-158  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2401  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.99 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2409  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6860  hypothetical protein  25.21 
 
 		 273 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2834  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.1 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0703  hypothetical protein  26.94 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3028  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.6 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1491  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.37 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2826  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.69 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1804  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.27 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.315624  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0332  GvpF  22.01 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.734625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2350  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.71 
 
 		 264 aa  62  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2386  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.3 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2339  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.3 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2380  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.3 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461085  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1486  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.23 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1807  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.98 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0073  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.83 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.494868  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2335  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.59 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90915  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2376  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.59 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2382  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.59 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0055  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.24 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00610804  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0700  hypothetical protein  22.63 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0698  hypothetical protein  25.48 
 
 		 343 aa  54.7  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4132  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.14 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4701  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.9 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2367  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.02 
 
 		 316 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0338  GvpL  20.08 
 
 		 267 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2355  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.62 
 
 		 243 aa  52.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0335  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.16 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3023  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.16 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0213  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.51 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3387  gas vesicle synthesis GvpLF  21.3 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4011  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.42 
 
 		 441 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.923293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1005  hypothetical protein  38.3 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2373  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  19.22 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1258  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.23 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.811139 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>