28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4705 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4705  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  100 
 
 		 256 aa  512  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6856  hypothetical protein  50 
 
 		 270 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2335  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  43.57 
 
 		 264 aa  204  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2382  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  43.57 
 
 		 264 aa  204  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2376  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  43.57 
 
 		 264 aa  204  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3383  gas vesicle synthesis GvpLF  45.19 
 
 		 270 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2355  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  35.71 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1807  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.54 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2401  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.95 
 
 		 279 aa  92.8  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2834  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.85 
 
 		 249 aa  92.4  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0700  hypothetical protein  25.31 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3028  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.22 
 
 		 250 aa  89  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4007  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  31 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1007  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  34.34 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1808  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.58 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.580439  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0073  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.08 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.177784  hitchhiker  0.00184802 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0338  GvpL  25.86 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2339  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.09 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0186658 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2832  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.46 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0699  hypothetical protein  26.32 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3578  putative gas vesicle synthesis protein  26.72 
 
 		 254 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1258  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.27 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.811139 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3262  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.71 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1491  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.61 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6860  hypothetical protein  26.52 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2367  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.35 
 
 		 316 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0698  hypothetical protein  22 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2373  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.71 
 
 		 207 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>