34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0338 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0338  GvpL  100 
 
 		 267 aa  552  1e-156  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1486  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  32.81 
 
 		 368 aa  155  7e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0073  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  28.02 
 
 		 344 aa  142  7e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.494868  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2826  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  29.6 
 
 		 249 aa  139  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3023  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  28.03 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2367  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.1 
 
 		 316 aa  122  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0341  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.67 
 
 		 360 aa  118  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2401  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.94 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4705  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.86 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2339  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.01 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2386  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.01 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2380  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.01 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461085  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2350  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.14 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6856  hypothetical protein  21.62 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3387  gas vesicle synthesis GvpLF  22.47 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2376  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.28 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2382  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.28 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2335  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.28 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90915  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1258  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.81 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.811139 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1808  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.03 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.580439  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0703  hypothetical protein  21.51 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0699  hypothetical protein  21.32 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0700  hypothetical protein  21.13 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1804  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.74 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.315624  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0705  hypothetical protein  23.55 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1248  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.08 
 
 		 270 aa  53.1  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1491  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  19.61 
 
 		 261 aa  53.1  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2834  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.05 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3028  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.1 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1807  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  19.22 
 
 		 258 aa  50.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6860  hypothetical protein  21.43 
 
 		 273 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2373  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.09 
 
 		 207 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3383  gas vesicle synthesis GvpLF  19.85 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0073  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.19 
 
 		 244 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.177784  hitchhiker  0.00184802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>