29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3023 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3023  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  100 
 
 		 259 aa  525  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0073  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  33.6 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.494868  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1486  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  30.56 
 
 		 368 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0338  GvpL  28.03 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2826  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  29.64 
 
 		 249 aa  129  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2367  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.14 
 
 		 316 aa  118  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0341  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.23 
 
 		 360 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2401  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.53 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1807  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1491  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.86 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0700  hypothetical protein  25.1 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6860  hypothetical protein  21.76 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0703  hypothetical protein  23.47 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6856  hypothetical protein  22.8 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1248  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.16 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1804  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.31 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.315624  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2339  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.9 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0073  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.34 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.177784  hitchhiker  0.00184802 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2386  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.9 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2380  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.9 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461085  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4701  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  18.6 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2335  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.67 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90915  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2376  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.67 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2382  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.67 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1808  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.84 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.580439  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3028  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.09 
 
 		 250 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2350  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.18 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2832  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.34 
 
 		 324 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0070  hypothetical protein  25.76 
 
 		 227 aa  42.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0872353  hitchhiker  0.00188887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>