37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6856 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6856  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  530  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3383  gas vesicle synthesis GvpLF  55.56 
 
 		 270 aa  275  5e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2335  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  53.17 
 
 		 264 aa  262  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2382  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  53.17 
 
 		 264 aa  262  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2376  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  53.17 
 
 		 264 aa  262  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4705  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  50 
 
 		 256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2401  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0700  hypothetical protein  28.03 
 
 		 259 aa  102  8e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3028  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.52 
 
 		 250 aa  95.5  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1808  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.62 
 
 		 257 aa  95.5  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.580439  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2355  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  33.73 
 
 		 243 aa  92.4  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2834  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.03 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1807  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.34 
 
 		 258 aa  89.4  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0699  hypothetical protein  28.57 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0073  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.28 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.177784  hitchhiker  0.00184802 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1258  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.58 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.811139 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1491  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.45 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2832  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.12 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4007  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  34.97 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1007  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  35.06 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0338  GvpL  21.62 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1809  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.55 
 
 		 339 aa  55.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.835829  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2339  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.31 
 
 		 266 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0186658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6860  hypothetical protein  31.09 
 
 		 273 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0213  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  45.16 
 
 		 300 aa  53.1  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3023  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.8 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2350  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  29.39 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3387  gas vesicle synthesis GvpLF  28.46 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1486  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.02 
 
 		 368 aa  49.3  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0335  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.8 
 
 		 211 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0698  hypothetical protein  24.22 
 
 		 343 aa  46.2  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1802  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.96 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2340  hypothetical protein  28.57 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0184096 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2409  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.68 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2826  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.62 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2373  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.9 
 
 		 207 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0703  hypothetical protein  23.66 
 
 		 262 aa  42  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>