18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1007 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1007  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  100 
 
 		 272 aa  528  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4007  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  58.09 
 
 		 289 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3028  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.12 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4705  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  31.2 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3383  gas vesicle synthesis GvpLF  31.71 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2355  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  32.02 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6856  hypothetical protein  31.74 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2376  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  30.2 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2382  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  30.2 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2335  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  30.2 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90915  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0700  hypothetical protein  28.35 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2834  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.88 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1807  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25 
 
 		 258 aa  72  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2401  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.73 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1491  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.95 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2832  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.7 
 
 		 324 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1808  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.92 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.580439  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0073  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.177784  hitchhiker  0.00184802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>