45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2834 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2834  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  100 
 
 		 249 aa  511  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3028  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  38.78 
 
 		 250 aa  198  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2401  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  42.39 
 
 		 279 aa  193  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0700  hypothetical protein  39.84 
 
 		 259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0699  hypothetical protein  40.32 
 
 		 260 aa  178  7e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1807  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  40 
 
 		 258 aa  175  7e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1491  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  36 
 
 		 261 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1808  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  39.26 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.580439  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2832  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  31.17 
 
 		 324 aa  115  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4705  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.85 
 
 		 256 aa  92.4  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3383  gas vesicle synthesis GvpLF  27.62 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6856  hypothetical protein  26.03 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3029  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.51 
 
 		 357 aa  85.5  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0332  GvpF  29.22 
 
 		 219 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.734625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4007  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  29.52 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0698  hypothetical protein  27.31 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2382  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.85 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2376  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.85 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2335  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.85 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90915  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1248  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.1 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0073  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.29 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.177784  hitchhiker  0.00184802 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0335  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.31 
 
 		 211 aa  75.1  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2826  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.36 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0055  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  29.11 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00610804  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1809  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.99 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.835829  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1258  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.57 
 
 		 268 aa  72  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.811139 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2355  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.41 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2373  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.7 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1007  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.75 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1486  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.41 
 
 		 368 aa  57  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6860  hypothetical protein  25.56 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687823  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2350  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.35 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2339  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.46 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0186658 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4132  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.4 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2380  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.66 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461085  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2386  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.66 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2339  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.66 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0073  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.14 
 
 		 344 aa  53.9  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.494868  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3387  gas vesicle synthesis GvpLF  26.72 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0703  hypothetical protein  23.62 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0338  GvpL  22.05 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2407  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.41 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.797019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0070  hypothetical protein  23.79 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0872353  hitchhiker  0.00188887 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0213  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.99 
 
 		 300 aa  46.6  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1802  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  18.35 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>