48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3028 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3028  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  100 
 
 		 250 aa  513  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2834  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  38.78 
 
 		 249 aa  198  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1807  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  38.71 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0700  hypothetical protein  39.52 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2401  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  31.28 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1808  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  31.98 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.580439  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1491  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  32.93 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0699  hypothetical protein  32.14 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0073  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  29.03 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.177784  hitchhiker  0.00184802 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2832  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.1 
 
 		 324 aa  99.4  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3383  gas vesicle synthesis GvpLF  28.81 
 
 		 270 aa  97.1  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6856  hypothetical protein  25.52 
 
 		 270 aa  95.5  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2826  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.8 
 
 		 249 aa  91.7  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2376  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.32 
 
 		 264 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2335  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.32 
 
 		 264 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2382  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.32 
 
 		 264 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4705  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.22 
 
 		 256 aa  89  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2355  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  30.47 
 
 		 243 aa  89  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1258  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.83 
 
 		 268 aa  88.6  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.811139 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1486  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  29.23 
 
 		 368 aa  87  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2373  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.5 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0332  GvpF  26.61 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.734625 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0698  hypothetical protein  24.02 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0055  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00610804  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2339  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.66 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0186658 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1248  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.6 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0335  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.51 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1007  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.36 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2380  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.31 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461085  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2386  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.31 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2339  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.31 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3029  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.48 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1809  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.03 
 
 		 339 aa  58.9  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.835829  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4007  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.29 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6860  hypothetical protein  24.82 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1802  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.6 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4701  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.31 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0073  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25 
 
 		 344 aa  52  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.494868  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0338  GvpL  22.1 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0213  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.25 
 
 		 300 aa  49.7  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2350  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.1 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0705  hypothetical protein  23.45 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2367  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.07 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0703  hypothetical protein  22.14 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3578  putative gas vesicle synthesis protein  20.18 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3262  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.18 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2409  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.94 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1249  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.16 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0503578 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>