23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2339 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2339  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  100 
 
 		 266 aa  542  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0186658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0073  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  52 
 
 		 244 aa  241  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.177784  hitchhiker  0.00184802 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2401  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.52 
 
 		 279 aa  89  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3028  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.66 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1491  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.6 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0700  hypothetical protein  24.62 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4705  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.09 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1807  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.01 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1258  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.58 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.811139 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3383  gas vesicle synthesis GvpLF  22.78 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2834  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.46 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6856  hypothetical protein  22.31 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3578  putative gas vesicle synthesis protein  23.15 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1486  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.19 
 
 		 368 aa  53.5  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3262  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.15 
 
 		 254 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0699  hypothetical protein  23.3 
 
 		 260 aa  53.1  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2376  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.31 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2382  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.31 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2335  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.31 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90915  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0698  hypothetical protein  22.91 
 
 		 343 aa  51.6  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2826  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  19.17 
 
 		 249 aa  49.3  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2373  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.16 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3029  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.18 
 
 		 357 aa  42  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>