32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2373 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2373  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  100 
 
 		 207 aa  413  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0335  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  77.29 
 
 		 211 aa  320  8e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0332  GvpF  30.1 
 
 		 219 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.734625 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2401  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.35 
 
 		 279 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0055  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  31.11 
 
 		 205 aa  104  9e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00610804  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3028  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.5 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0700  hypothetical protein  26.1 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1807  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.8 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1491  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.4 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2834  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.5 
 
 		 249 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2832  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.6 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0073  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.33 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.177784  hitchhiker  0.00184802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4701  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.78 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2826  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.1 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3383  gas vesicle synthesis GvpLF  27.35 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0703  hypothetical protein  23.33 
 
 		 262 aa  52.4  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4132  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.21 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1258  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.04 
 
 		 268 aa  50.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.811139 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2409  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.14 
 
 		 259 aa  49.3  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0698  hypothetical protein  21.91 
 
 		 343 aa  49.3  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2380  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.06 
 
 		 263 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461085  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2386  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.06 
 
 		 263 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2339  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.06 
 
 		 263 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2339  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.16 
 
 		 266 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0186658 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0338  GvpL  21.09 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1486  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.72 
 
 		 368 aa  46.6  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0213  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.73 
 
 		 300 aa  46.2  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1248  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  19.22 
 
 		 270 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6856  hypothetical protein  24.9 
 
 		 270 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4705  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.71 
 
 		 256 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1808  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.86 
 
 		 257 aa  42.4  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.580439  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0070  hypothetical protein  22.69 
 
 		 227 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0872353  hitchhiker  0.00188887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>