35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2409 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2409  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  100 
 
 		 259 aa  526  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4701  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  30.16 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1248  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.55 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2339  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.68 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2380  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.68 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461085  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2386  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.68 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6860  hypothetical protein  25.23 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687823  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2350  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.81 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3387  gas vesicle synthesis GvpLF  23.75 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2401  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.83 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4011  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.38 
 
 		 441 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.923293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0703  hypothetical protein  25.81 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0055  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.32 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00610804  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1802  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.2 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0332  GvpF  25.73 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.734625 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0213  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.44 
 
 		 300 aa  52.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1809  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.71 
 
 		 339 aa  51.6  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.835829  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1491  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.99 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2373  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.14 
 
 		 207 aa  49.7  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0070  hypothetical protein  29.47 
 
 		 227 aa  49.3  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0872353  hitchhiker  0.00188887 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0335  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.01 
 
 		 211 aa  48.9  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4132  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.89 
 
 		 248 aa  48.9  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1486  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.47 
 
 		 368 aa  48.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3383  gas vesicle synthesis GvpLF  25.67 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2355  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.33 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1258  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.12 
 
 		 268 aa  45.8  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.811139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2826  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.65 
 
 		 249 aa  45.8  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1807  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  18.95 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1249  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.78 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0503578 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0705  hypothetical protein  26.53 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6856  hypothetical protein  25.68 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3028  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.94 
 
 		 250 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0700  hypothetical protein  22.18 
 
 		 259 aa  43.5  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1804  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  18.06 
 
 		 266 aa  42.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.315624  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0073  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.7 
 
 		 344 aa  42.4  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.494868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>