23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0705 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0705  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  479  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1802  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.7 
 
 		 249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2401  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.04 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4701  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.63 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4132  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  19.25 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0070  hypothetical protein  23.94 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0872353  hitchhiker  0.00188887 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0338  GvpL  23.55 
 
 		 267 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1258  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.39 
 
 		 268 aa  52.4  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.811139 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1249  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.64 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0503578 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0332  GvpF  19.68 
 
 		 219 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.734625 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0335  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  28.21 
 
 		 211 aa  48.9  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3387  gas vesicle synthesis GvpLF  28.12 
 
 		 280 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6860  hypothetical protein  26.09 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3262  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  38.24 
 
 		 254 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1808  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.65 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.580439  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3578  putative gas vesicle synthesis protein  38.24 
 
 		 254 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2386  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  30.05 
 
 		 263 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2339  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  30.05 
 
 		 263 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2380  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  30.05 
 
 		 263 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461085  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3028  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.45 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2409  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.53 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0073  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.9 
 
 		 344 aa  42  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.494868  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2355  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.29 
 
 		 243 aa  42  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>