21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0070 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0070  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0872353  hitchhiker  0.00188887 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2340  hypothetical protein  35.11 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0184096 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0705  hypothetical protein  23.94 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1258  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.53 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.811139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2834  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.79 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1249  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.45 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0503578 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2409  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  29.47 
 
 		 259 aa  49.7  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0335  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2339  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.14 
 
 		 263 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2380  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.14 
 
 		 263 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461085  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2386  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.14 
 
 		 263 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2401  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.54 
 
 		 279 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2355  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.12 
 
 		 243 aa  45.4  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0073  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.34 
 
 		 344 aa  45.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.494868  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2407  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.07 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.797019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1491  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  37.5 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3383  gas vesicle synthesis GvpLF  25.53 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4132  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.42 
 
 		 248 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2373  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.69 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1802  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.24 
 
 		 249 aa  42  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0703  hypothetical protein  22.8 
 
 		 262 aa  41.6  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>