33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0332 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0332  GvpF  100 
 
 		 219 aa  448  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.734625 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0055  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  44.5 
 
 		 205 aa  184  7e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00610804  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2373  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  30.1 
 
 		 207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0335  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  30.37 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2401  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.94 
 
 		 279 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1491  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  28.05 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2834  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  29.22 
 
 		 249 aa  85.1  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3028  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.61 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1807  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  28.46 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2350  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.71 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0700  hypothetical protein  25.48 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1808  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.17 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.580439  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1248  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.01 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4132  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.1 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2826  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.29 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2832  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.89 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4701  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.44 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2409  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.73 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2339  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.18 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2386  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.18 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2380  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.18 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461085  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1486  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  18.7 
 
 		 368 aa  53.9  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0703  hypothetical protein  20.93 
 
 		 262 aa  52  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0073  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.35 
 
 		 344 aa  51.6  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.494868  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2355  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.25 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0213  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  19.83 
 
 		 300 aa  50.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0705  hypothetical protein  19.68 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4011  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  30.67 
 
 		 441 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.923293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2407  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  19.72 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.797019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1258  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.9 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.811139 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1249  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0503578 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1802  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  17.71 
 
 		 249 aa  43.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0699  hypothetical protein  28.33 
 
 		 260 aa  42.4  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>