30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3387 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3387  gas vesicle synthesis GvpLF  100 
 
 		 280 aa  550  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6860  hypothetical protein  56.06 
 
 		 273 aa  285  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2380  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  45.95 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461085  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2386  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  45.95 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2339  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  45.95 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4701  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  39.33 
 
 		 254 aa  165  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2350  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  43.46 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0213  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  28.85 
 
 		 300 aa  89  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1804  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.51 
 
 		 266 aa  72  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.315624  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2401  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.67 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2409  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.52 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0073  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.47 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.494868  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0338  GvpL  23.42 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0703  hypothetical protein  23.4 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1491  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.91 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1808  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.55 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.580439  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0705  hypothetical protein  28.12 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1258  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.96 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.811139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4011  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.89 
 
 		 441 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.923293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2834  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.34 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1248  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.66 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0700  hypothetical protein  24.29 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6856  hypothetical protein  28.26 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0699  hypothetical protein  25.7 
 
 		 260 aa  52.8  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2826  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.44 
 
 		 249 aa  49.7  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0335  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  45.28 
 
 		 211 aa  46.6  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2355  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.32 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3383  gas vesicle synthesis GvpLF  33.86 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0698  hypothetical protein  31.52 
 
 		 343 aa  43.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1486  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.73 
 
 		 368 aa  42.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>