35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2350 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2350  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  100 
 
 		 264 aa  526  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6860  hypothetical protein  44.31 
 
 		 273 aa  181  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687823  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3387  gas vesicle synthesis GvpLF  43.08 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2339  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  42.24 
 
 		 263 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2386  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  42.24 
 
 		 263 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2380  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  42.24 
 
 		 263 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461085  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4701  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  34.68 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2401  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.84 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0332  GvpF  22.71 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.734625 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1248  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.77 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0703  hypothetical protein  25.1 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2409  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.19 
 
 		 259 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0338  GvpL  26.3 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0213  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.52 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1804  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.65 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.315624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2834  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.35 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1491  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.44 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0700  hypothetical protein  25.75 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4132  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.55 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3028  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.1 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6856  hypothetical protein  30.42 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1807  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  19.57 
 
 		 258 aa  49.7  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0073  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.11 
 
 		 344 aa  50.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.494868  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2826  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.26 
 
 		 249 aa  48.9  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2355  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.47 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1258  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.96 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.811139 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2367  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.24 
 
 		 316 aa  46.6  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2382  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  28.68 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2335  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  28.68 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90915  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2376  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  28.68 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4011  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.74 
 
 		 441 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.923293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1486  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.46 
 
 		 368 aa  45.4  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0341  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.08 
 
 		 360 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4705  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  29.59 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3023  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.18 
 
 		 259 aa  42.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627745  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>