21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4011 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4011  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  100 
 
 
441 aa  846    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.923293  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1005  hypothetical protein  66.67 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2409  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.61 
 
 
259 aa  67  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479683  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2339  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  28.47 
 
 
263 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2386  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  28.47 
 
 
263 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120211  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2380  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  28.47 
 
 
263 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461085  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4701  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.67 
 
 
254 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1248  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.48 
 
 
270 aa  57  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6860  hypothetical protein  29.15 
 
 
273 aa  56.6  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687823  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0213  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.75 
 
 
300 aa  53.5  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1258  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25 
 
 
268 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.811139 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1804  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  18.45 
 
 
266 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.315624  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2355  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  30.65 
 
 
243 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2401  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.42 
 
 
279 aa  49.7  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3387  gas vesicle synthesis GvpLF  27.89 
 
 
280 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19053  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3029  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.82 
 
 
357 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0332  GvpF  28 
 
 
219 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.734625 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0703  hypothetical protein  22.99 
 
 
262 aa  47.8  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2350  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.74 
 
 
264 aa  47  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0055  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.44 
 
 
205 aa  43.9  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00610804  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1802  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  17.55 
 
 
249 aa  43.9  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>