More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_31237 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_31237  predicted protein  100 
 
 
142 aa  296  5e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.652624  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62909  predicted protein  35.88 
 
 
324 aa  90.9  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.288308  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2074  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0018  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
388 aa  72  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.253679  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3191  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
375 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2928  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
375 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  48.39 
 
 
370 aa  70.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3476  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
369 aa  71.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  48.39 
 
 
370 aa  70.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1437  chaperone protein DnaJ  42.11 
 
 
379 aa  70.9  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  45.83 
 
 
341 aa  70.9  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04060  endoplasmic reticulum protein, putative  34.88 
 
 
445 aa  70.5  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5455  chaperone protein DnaJ  46.97 
 
 
389 aa  70.5  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5061  chaperone DnaJ domain protein  47.83 
 
 
303 aa  70.5  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0023  chaperone protein DnaJ  37.97 
 
 
384 aa  70.1  0.000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0451  chaperone protein DnaJ  46.03 
 
 
371 aa  70.1  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.240923 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  36.17 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  47.62 
 
 
313 aa  68.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  47.06 
 
 
388 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  48.39 
 
 
373 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  41.54 
 
 
359 aa  68.2  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  46.77 
 
 
327 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  36.79 
 
 
377 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1308  DnaJ-like molecular chaperone  41.54 
 
 
309 aa  67.8  0.00000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.571116  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  48.39 
 
 
314 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  40 
 
 
356 aa  67.4  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  40 
 
 
356 aa  67.4  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0805  protein translation intiation inhibitor  39.24 
 
 
296 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000779647  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0379  chaperone protein DnaJ  45.31 
 
 
376 aa  67.4  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4435  chaperone DnaJ domain protein  45.31 
 
 
311 aa  67.4  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  45.16 
 
 
315 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  44.29 
 
 
386 aa  67.4  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  46.77 
 
 
324 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2103  heat shock protein DnaJ domain protein  40.45 
 
 
220 aa  67.4  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000586336  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6288  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.28 
 
 
313 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.524726  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0839  heat shock protein DnaJ  43.75 
 
 
379 aa  67  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0215483  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00161  chaperone protein DnaJ  45.16 
 
 
374 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.108884  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2130  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.93 
 
 
323 aa  67  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192509  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.55 
 
 
315 aa  67  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  44.93 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0017  chaperone protein DnaJ  45.16 
 
 
374 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.629489  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00161  chaperone protein DnaJ  45.16 
 
 
374 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.453934  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0739  chaperone protein DnaJ  47.62 
 
 
355 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0784  chaperone protein DnaJ  45.31 
 
 
377 aa  66.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0590762 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  35.92 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3252  chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 
376 aa  65.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199351  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  47.06 
 
 
386 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  40.26 
 
 
375 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  33.72 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0764  chaperone protein DnaJ  40.21 
 
 
397 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252459  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  44.44 
 
 
382 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  33.72 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  44.44 
 
 
382 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  46.88 
 
 
375 aa  66.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  44.44 
 
 
382 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1980  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
378 aa  65.5  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7057  chaperone protein DnaJ  45.31 
 
 
378 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409815  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  43.94 
 
 
339 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00161  chaperone protein DnaJ  45.16 
 
 
374 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0013  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.98 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000027802  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1647  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
379 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51193  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  45.16 
 
 
376 aa  65.5  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0511  chaperone protein DnaJ  44.62 
 
 
378 aa  65.1  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.100964  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00171  chaperone protein DnaJ  38.75 
 
 
377 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0387416 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1088  chaperone protein DnaJ  37.86 
 
 
394 aa  64.7  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.038983  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0143  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.48 
 
 
297 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000524271  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2290  chaperone DnaJ  43.55 
 
 
380 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  43.48 
 
 
313 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf297  heat shock protein DnaJ  40.26 
 
 
369 aa  64.3  0.0000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.302595  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  46.03 
 
 
324 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1255  chaperone protein DnaJ  44.44 
 
 
297 aa  64.3  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559961  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1855  dnaJ protein  38.46 
 
 
377 aa  64.3  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07680  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
373 aa  64.3  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.447562 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0009  chaperone protein DnaJ  34.38 
 
 
376 aa  64.3  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0447538  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  47.62 
 
 
385 aa  63.9  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1904  chaperone protein DnaJ  46.88 
 
 
391 aa  64.3  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  44 
 
 
374 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  44 
 
 
375 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  43.55 
 
 
382 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1571  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.24 
 
 
348 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10330  chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 
375 aa  63.9  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0686048  unclonable  0.00000000184085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6429  chaperone DnaJ domain protein  36.71 
 
 
324 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1065  DnaJ domain-containing protein  36.71 
 
 
298 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1454  chaperone protein DnaJ  33.65 
 
 
368 aa  63.5  0.0000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.142529  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1511  chaperone protein DnaJ  33.65 
 
 
368 aa  63.9  0.0000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.577618  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00211  chaperone protein DnaJ  45.16 
 
 
378 aa  63.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1422  chaperone protein DnaJ  47.06 
 
 
400 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.234078  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0213  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.68 
 
 
291 aa  63.9  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0942  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  36.96 
 
 
377 aa  63.9  0.0000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.122373  normal  0.06017 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0009  chaperone protein DnaJ  41.27 
 
 
385 aa  63.9  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111301  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0823  chaperone protein DnaJ  41.94 
 
 
388 aa  63.5  0.0000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  46.03 
 
 
318 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  40.85 
 
 
313 aa  63.5  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1364  co-chaperone protein DnaJ  36.71 
 
 
297 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4504  dnaJ protein  45.33 
 
 
380 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3405  chaperone protein DnaJ  43.55 
 
 
375 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252508  normal  0.0948111 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0451  chaperone protein DnaJ  42.65 
 
 
375 aa  63.2  0.000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50996  predicted protein  31.45 
 
 
447 aa  63.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.235436  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  46.03 
 
 
377 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0285  chaperone DnaJ domain protein  39.06 
 
 
319 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>