27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1002 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1002  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
105 aa  217  5e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15290  heat shock protein DnaJ domain protein  43.96 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00372655  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0880  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.08 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0445243  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3911  heat shock protein DnaJ domain protein  34.62 
 
 
96 aa  51.2  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000487645  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0257  heat shock protein DnaJ-like  32.63 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.476509  normal  0.365369 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3995  heat shock protein DnaJ domain protein  33.33 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000305927 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1933  heat shock protein DnaJ-like  30.67 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0426036  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1264  heat shock protein DnaJ domain protein  42.03 
 
 
307 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0110281  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1763  dnaJ domain-containing protein  32.05 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0456509  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1348  heat shock protein DnaJ domain protein  37.1 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1959  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.67 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1443  DNAJ class chaperone; heat shock protein  41.43 
 
 
402 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3068  heat shock protein DnaJ-like  40 
 
 
206 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0510  chaperone DnaJ domain-containing protein  29.73 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4726  DnaJ central region:heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  35 
 
 
321 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  27.84 
 
 
297 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  27.84 
 
 
297 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4075  heat shock protein DnaJ domain protein  32.05 
 
 
96 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6495  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.33 
 
 
206 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0284031  decreased coverage  0.00341928 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  33.33 
 
 
741 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01120  chaperone regulator, putative  44 
 
 
361 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1244  chaperone protein DnaJ  36.54 
 
 
375 aa  41.2  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0723  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.25 
 
 
326 aa  40.4  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2810  heat shock protein DnaJ  42.31 
 
 
380 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00638264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  37.7 
 
 
298 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3592  heat shock protein DnaJ domain protein  33.33 
 
 
205 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.329646  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2736  heat shock protein DnaJ-like  36.23 
 
 
201 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.302164 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>