75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3911 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3911  heat shock protein DnaJ domain protein  100 
 
 
96 aa  201  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000487645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3995  heat shock protein DnaJ domain protein  90.62 
 
 
96 aa  186  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000305927 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4075  heat shock protein DnaJ domain protein  71.88 
 
 
96 aa  155  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1763  dnaJ domain-containing protein  60.64 
 
 
96 aa  124  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0456509  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1959  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  61.7 
 
 
105 aa  124  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1933  heat shock protein DnaJ-like  60.42 
 
 
97 aa  118  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0426036  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0510  chaperone DnaJ domain-containing protein  52.13 
 
 
97 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2174  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  55.32 
 
 
96 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2181  heat shock protein DnaJ domain protein  47.92 
 
 
102 aa  95.9  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00441328  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1230  heat shock protein DnaJ-like  39.02 
 
 
90 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15290  heat shock protein DnaJ domain protein  36.84 
 
 
107 aa  61.2  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00372655  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0257  heat shock protein DnaJ-like  31.25 
 
 
103 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.476509  normal  0.365369 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1002  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.62 
 
 
105 aa  51.2  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1088  heat shock protein DnaJ-like  54 
 
 
258 aa  50.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1895  heat shock protein DnaJ domain protein  35 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0546  DnaJ-like protein  36.51 
 
 
256 aa  48.1  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26301  putative heat shock protein DnaJ  52 
 
 
232 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0880  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.7 
 
 
103 aa  47  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0445243  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  49.09 
 
 
197 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884874  normal  0.323014 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0536  heat shock protein DnaJ-like  52.63 
 
 
219 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.957898  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0451  chaperone protein DnaJ  34.78 
 
 
375 aa  45.4  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3068  heat shock protein DnaJ-like  62.16 
 
 
206 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0401  heat shock protein DnaJ  55.26 
 
 
232 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.337808 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01371  putative heat shock protein DnaJ  42.86 
 
 
232 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.333222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1138  chaperone DnaJ-like  35.38 
 
 
325 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7569  hypothetical protein  50 
 
 
189 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0496  heat shock protein DnaJ-like  52.63 
 
 
218 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1987  heat shock protein DnaJ domain protein  31.25 
 
 
424 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.657228 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2364  heat shock protein DnaJ-like  48.98 
 
 
222 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.719019  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1391  heat shock protein DnaJ domain protein  33.85 
 
 
322 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83675  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0589  heat shock protein DnaJ domain protein  40.35 
 
 
347 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00109481  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.37 
 
 
334 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1630  silent information regulator protein Sir2  48.48 
 
 
244 aa  42.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071584  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1309  chaperone DnaJ-like  35.38 
 
 
323 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0624  heat shock protein DnaJ  35.38 
 
 
316 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.541417  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2561  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.59 
 
 
211 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.747799 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3592  heat shock protein DnaJ domain protein  54.05 
 
 
205 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.329646  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0639  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.14 
 
 
331 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2015  chaperone DnaJ  36.76 
 
 
333 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0999133  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0668  DnaJ domain-containing protein  57.14 
 
 
265 aa  41.6  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.165012  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0618  heat shock protein DnaJ domain protein  44 
 
 
331 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1713  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50 
 
 
187 aa  41.6  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01361  putative heat shock protein DnaJ  41.38 
 
 
225 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.105788  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  36.67 
 
 
379 aa  41.2  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  39.68 
 
 
307 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2389  heat shock protein DnaJ-like  38.98 
 
 
266 aa  41.2  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464202 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0800  chaperone protein DnaJ  43.4 
 
 
378 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0487  heat shock protein DnaJ domain protein  40.38 
 
 
201 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.670456  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0501  heat shock protein DnaJ domain protein  50 
 
 
214 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl414  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
374 aa  41.2  0.005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3426  heat shock protein DnaJ domain protein  44.07 
 
 
237 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0125  putative heat shock protein DnaJ  40 
 
 
225 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0539  heat shock protein DnaJ-like  50 
 
 
215 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1207  heat shock protein DnaJ  32.31 
 
 
323 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.480945 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0767  chaperone DnaJ-like  35.38 
 
 
319 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.937963  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0018  DnaJ domain protein  37.68 
 
 
292 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3732  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.84 
 
 
423 aa  40.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.143539  normal  0.0525791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3885  heat shock protein DnaJ domain protein  51.35 
 
 
205 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02351  DnaJ-like molecular chaperone  34.92 
 
 
312 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  36.67 
 
 
335 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.84 
 
 
319 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4007  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.44 
 
 
253 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2014  chaperone DnaJ-like  41.67 
 
 
316 aa  40.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  35 
 
 
298 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5061  chaperone DnaJ domain protein  37.74 
 
 
303 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2957  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  48.57 
 
 
204 aa  40  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0976  heat shock protein DnaJ-like  46 
 
 
256 aa  40.4  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.156674  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  40 
 
 
336 aa  40.4  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0047  heat shock protein DnaJ-like  40 
 
 
330 aa  40.4  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.940459  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0913  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40 
 
 
209 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_42151  predicted protein  36.84 
 
 
402 aa  40  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  37.29 
 
 
301 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0326  heat shock protein DnaJ-like  42.37 
 
 
222 aa  40  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3231  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  51.22 
 
 
235 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3555  heat shock protein DnaJ domain protein  51.22 
 
 
235 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596429  normal  0.325089 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>