258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_221 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_221  molecular chaperone, DnaJ-family  100 
 
 
104 aa  218  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0616  putative chaperonin  39.39 
 
 
250 aa  52  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9549  predicted protein  40.74 
 
 
69 aa  50.8  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.251932  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0976  co-chaperone protein DnaJ  41.82 
 
 
295 aa  50.8  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.984114  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2006  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.79 
 
 
246 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0210769 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0208  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.33 
 
 
206 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15297  predicted protein  33.73 
 
 
445 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.121195 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03720  DnaJ domain containing protein  40.62 
 
 
249 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.338466  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92168  predicted protein  42.11 
 
 
200 aa  48.5  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.240316  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7804  putative heat shock protein- DnaJ-like protein  45.45 
 
 
336 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108723  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0900  putative chaperone protein DnaJ  41.82 
 
 
383 aa  48.5  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0629  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 
393 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1147  chaperone protein DnaJ  38.18 
 
 
373 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0787  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.07 
 
 
292 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.212048 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1364  co-chaperone protein DnaJ  40.74 
 
 
297 aa  47.8  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 
389 aa  47.8  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0496  co-chaperone protein DnaJ  40.74 
 
 
294 aa  47.8  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0272184  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1243  co-chaperone protein DnaJ  40.74 
 
 
297 aa  47.8  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00000103422  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  42.11 
 
 
380 aa  47.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  42.11 
 
 
379 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2674  chaperone DnaJ domain protein  40.35 
 
 
309 aa  47  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1311  DnaJ-class molecular chaperone  41.82 
 
 
341 aa  46.6  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1549  chaperone DnaJ domain protein  45.28 
 
 
372 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2577  chaperone protein DnaJ  41.07 
 
 
385 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00027839 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0009  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 
376 aa  46.2  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0447538  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0765  co-chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
290 aa  46.2  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000175229  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13440  chaperone protein DnaJ  45.28 
 
 
372 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67817  predicted protein  36.36 
 
 
511 aa  46.2  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.695962  normal  0.0282737 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10778  mitochondrial DnaJ chaperone (Mdj1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11750)  35.59 
 
 
547 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0430541 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04441  ER associated DnaJ chaperone (Hlj1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07330)  37.25 
 
 
339 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.920057 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  39.29 
 
 
372 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  42.59 
 
 
379 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0826  heat shock protein DnaJ domain protein  36.51 
 
 
241 aa  45.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000315568  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  40.35 
 
 
318 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  40.35 
 
 
318 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3415  Dna-J like membrane chaperone protein  35.53 
 
 
284 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.258634  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2702  chaperone protein DnaJ  37.74 
 
 
381 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 
377 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0885  Dna-J like membrane chaperone protein  37.14 
 
 
258 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00720639  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2529  chaperone protein DnaJ  37.04 
 
 
379 aa  45.4  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  40.35 
 
 
318 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1837  DnaJ domain-containing protein  50 
 
 
264 aa  45.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02040  DNAj protein, putative  35.71 
 
 
503 aa  45.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04060  endoplasmic reticulum protein, putative  37.25 
 
 
445 aa  45.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4909  protein of unknown function DUF1332  34.33 
 
 
245 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296192  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1065  DnaJ domain-containing protein  38.89 
 
 
298 aa  45.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0934  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.89 
 
 
320 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0828376 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 
376 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1747  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.38 
 
 
251 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000151297  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  37.5 
 
 
366 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0702  chaperone protein DnaJ  37.29 
 
 
379 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2865  Dna-J like membrane chaperone protein  36.49 
 
 
284 aa  44.3  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787957  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  42.59 
 
 
378 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  43.86 
 
 
298 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  32.86 
 
 
377 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1671  chaperone protein DnaJ  36.36 
 
 
379 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1644  chaperone protein DnaJ  41.51 
 
 
374 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1020  Dna-J like membrane chaperone protein  34.29 
 
 
259 aa  44.3  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.325317  normal  0.0319615 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1637  chaperone protein DnaJ  36.36 
 
 
379 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.203531  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0778  co-chaperone-curved DNA binding protein A  37.04 
 
 
288 aa  44.3  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 
373 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0023  chaperone protein DnaJ  36.36 
 
 
384 aa  44.3  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_42151  predicted protein  41.18 
 
 
402 aa  44.3  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2921  chaperone protein DnaJ  42.59 
 
 
379 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121301  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 
379 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3203  Dna-J like membrane chaperone protein  34.29 
 
 
262 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.967283 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0805  protein translation intiation inhibitor  38.89 
 
 
296 aa  44.3  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000779647  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0143  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.86 
 
 
297 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000524271  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0911  Dna-J like membrane chaperone protein  34.29 
 
 
262 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0269993  normal  0.373919 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3306  Dna-J like membrane chaperone protein  34.29 
 
 
262 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.044478  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1052  Dna-J like membrane chaperone protein  34.29 
 
 
262 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0982922  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2191  chaperone DnaJ domain protein  40 
 
 
374 aa  43.9  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0995  Dna-J like membrane chaperone protein  34.29 
 
 
262 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.555246  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00670  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  35 
 
 
321 aa  43.9  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.772796  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0983  Dna-J like membrane chaperone protein  34.29 
 
 
262 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.193447  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  40.74 
 
 
378 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  40.74 
 
 
376 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0970  Dna-J like membrane chaperone protein  32.43 
 
 
259 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0207673  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  40.74 
 
 
376 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  38.6 
 
 
376 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3109  Dna-J like membrane chaperone protein  34.29 
 
 
262 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  40.74 
 
 
378 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0097  chaperone protein DnaJ  37.74 
 
 
361 aa  43.9  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00841674 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  40.74 
 
 
376 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  40.74 
 
 
376 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  40.74 
 
 
376 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  40.74 
 
 
376 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  40.74 
 
 
376 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  40.74 
 
 
378 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1085  Dna-J like membrane chaperone protein  34.29 
 
 
262 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367802  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0100  heat shock protein DnaJ-like protein  31.65 
 
 
257 aa  43.5  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  40.74 
 
 
378 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  40.74 
 
 
378 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0800  chaperone protein DnaJ  40.74 
 
 
378 aa  43.5  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4394  chaperone protein DnaJ  37.5 
 
 
371 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000485596  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3432  chaperone protein DnaJ  36.36 
 
 
388 aa  42.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0520699  normal  0.082957 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0965  chaperone protein DnaJ  36.84 
 
 
380 aa  43.5  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0652035  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2869  chaperone protein DnaJ  40.74 
 
 
382 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0675  heat shock protein  33.87 
 
 
276 aa  43.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.745295  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1060  chaperone protein DnaJ  37.25 
 
 
380 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00149105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>