44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1396 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1396  DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
222 aa  422  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2148  heat shock protein DnaJ-like  48.89 
 
 
252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2499  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.11 
 
 
253 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86775  normal  0.0662441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3329  heat shock protein DnaJ-like  40.27 
 
 
245 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3059  heat shock protein DnaJ-like  48.67 
 
 
242 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1860  aconitate hydratase 2  33.19 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2256  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  48.99 
 
 
240 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.404984  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2421  heat shock protein DnaJ-like  39.82 
 
 
261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3560  heat shock protein DnaJ domain protein  46.98 
 
 
242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665124  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4778  hypothetical protein  45.89 
 
 
238 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2392  heat shock protein DnaJ-like  47.2 
 
 
244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1700  heat shock protein DnaJ  46.31 
 
 
298 aa  108  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.20246  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0751  heat shock protein DnaJ domain protein  42.04 
 
 
243 aa  108  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000868694 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4540  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.64 
 
 
242 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0499659  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0353  heat shock protein DnaJ domain protein  41.01 
 
 
241 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1671  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.76 
 
 
250 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.984207  normal  0.27085 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1370  heat shock protein DnaJ-like  47.53 
 
 
231 aa  99.4  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5266  heat shock protein DnaJ domain protein  44.9 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5342  heat shock protein DnaJ domain protein  40.74 
 
 
231 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4799  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.54 
 
 
231 aa  87  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.111411 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3491  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  58.33 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0791  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.67 
 
 
253 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.267414 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3891  heat shock protein DnaJ domain protein  54.55 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.717519 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0801  heat shock protein DnaJ, N-terminal  45.83 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0201  dnaJ domain-containing protein  51.72 
 
 
79 aa  68.6  0.00000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.138312  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38616  predicted protein  57.41 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.126504  normal  0.22468 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0818  DnaJ domain-containing protein  42.62 
 
 
128 aa  64.7  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1074  DnaJ domain-containing protein  42.42 
 
 
102 aa  62.8  0.000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0316124  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02230  chaperone, putative  45.71 
 
 
97 aa  62.4  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0113448  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45043  predicted protein  50.91 
 
 
153 aa  56.6  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.251497  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_8096  predicted protein  49.06 
 
 
67 aa  56.2  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2790  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  48.28 
 
 
130 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3317  heat shock protein DnaJ-like  50 
 
 
98 aa  55.5  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04559  Mitochondrial import inner membrane translocase subunit tim14 (Presequence translocated-associated motor subunit pam18) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4H1]  43.04 
 
 
105 aa  55.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1072  DnaJ domain-containing protein  43.64 
 
 
56 aa  53.5  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0676389  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0730  heat shock protein DnaJ domain protein  43.08 
 
 
276 aa  52  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0976  heat shock protein DnaJ-like  42.59 
 
 
256 aa  46.6  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.156674  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  37.1 
 
 
381 aa  46.2  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58189  mitochondrial chaperonin of the DnaJ family  41.67 
 
 
145 aa  46.2  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3147  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.17 
 
 
141 aa  45.8  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.144632 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04250  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  43.33 
 
 
282 aa  44.7  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0487  heat shock protein DnaJ domain protein  43.4 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.670456  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1718  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  52.31 
 
 
153 aa  42.7  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.82766  normal  0.111433 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1088  heat shock protein DnaJ-like  31.63 
 
 
258 aa  42.7  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>