More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0339 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0339  heat shock protein DnaJ-like  100 
 
 
196 aa  367  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3451  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  51.53 
 
 
169 aa  124  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.658734  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6456  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.96 
 
 
325 aa  78.2  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00677011 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2735  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  55.22 
 
 
315 aa  71.2  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.879449  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38015  predicted protein  47.46 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.964635  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1382  heat shock protein DnaJ domain protein  44.44 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.995337  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1503  heat shock protein DnaJ domain protein  35.56 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000293198 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2459  heat shock protein DnaJ domain protein  51.52 
 
 
314 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000295902 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1577  chaperone DnaJ  45.59 
 
 
377 aa  64.3  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.277961  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  46.88 
 
 
324 aa  63.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_42151  predicted protein  45.76 
 
 
402 aa  63.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  48.48 
 
 
383 aa  63.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0429  heat shock protein DnaJ-like  46.58 
 
 
111 aa  63.2  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.71 
 
 
330 aa  63.2  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  36.45 
 
 
336 aa  62  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1987  heat shock protein DnaJ domain protein  45.9 
 
 
424 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.657228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0527  chaperone protein DnaJ  45.71 
 
 
396 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  37.11 
 
 
297 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2458  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.03 
 
 
179 aa  61.6  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0746874 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1437  chaperone protein DnaJ  41.89 
 
 
379 aa  61.2  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00670  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  47.37 
 
 
321 aa  61.2  0.000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.772796  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0434  heat shock protein DnaJ domain protein  37.65 
 
 
230 aa  61.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  44.12 
 
 
388 aa  61.2  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0445  heat shock protein DnaJ domain protein  37.65 
 
 
230 aa  61.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00756538 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2511  heat shock protein DnaJ domain protein  44.62 
 
 
316 aa  60.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0350748  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3070  chaperone DnaJ domain protein  47.37 
 
 
315 aa  60.5  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0765  co-chaperone protein DnaJ  41.27 
 
 
290 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000175229  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1972  chaperone protein DnaJ  53.23 
 
 
375 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000781589 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  46.15 
 
 
320 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1962  chaperone protein DnaJ  44.44 
 
 
361 aa  60.1  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1000  heat shock protein DnaJ domain protein  39.44 
 
 
314 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0797  heat shock protein DnaJ domain protein  45.31 
 
 
369 aa  60.1  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.95295 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  50.82 
 
 
372 aa  60.5  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0023  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
384 aa  60.1  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1995  chaperone protein DnaJ  47.69 
 
 
379 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.396046  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2209  chaperone DnaJ domain protein  50 
 
 
374 aa  59.3  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.990749  hitchhiker  0.0052734 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_19643  predicted protein  42.37 
 
 
423 aa  59.3  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0479063  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2235  chaperone protein DnaJ  53.23 
 
 
375 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0177525  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1088  chaperone protein DnaJ  34.86 
 
 
394 aa  59.7  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.038983  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6429  chaperone DnaJ domain protein  49.21 
 
 
324 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_002936  DET1411  DnaJ family protein  38.24 
 
 
330 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0198  chaperone protein DnaJ  42.42 
 
 
404 aa  58.9  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0132968  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  43.94 
 
 
381 aa  58.9  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0018  chaperone protein DnaJ  40.62 
 
 
388 aa  58.9  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.253679  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  36.36 
 
 
314 aa  58.5  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  36.76 
 
 
330 aa  58.5  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5469  chaperone protein DnaJ  37.14 
 
 
387 aa  58.2  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6481  heat shock protein DnaJ domain protein  49.33 
 
 
383 aa  58.2  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  48.44 
 
 
373 aa  58.2  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0778  co-chaperone-curved DNA binding protein A  41.27 
 
 
288 aa  58.2  0.00000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  39.19 
 
 
375 aa  57.8  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1364  co-chaperone protein DnaJ  41.27 
 
 
297 aa  58.2  0.00000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0854  chaperone protein DnaJ  44.44 
 
 
395 aa  57.8  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000496587  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38560  chaperone protein DnaJ  43.94 
 
 
387 aa  57.8  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0413563  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1243  co-chaperone protein DnaJ  41.27 
 
 
297 aa  58.2  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00000103422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  41.79 
 
 
313 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04310  chaperone regulator, putative  42.86 
 
 
404 aa  57.4  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00566214  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1003  heat shock protein DnaJ domain protein  38.46 
 
 
311 aa  57.4  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  44.62 
 
 
318 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1980  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
378 aa  57.8  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0071  molecular chaperone, heat shock protein  41.54 
 
 
379 aa  57.4  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2925  chaperone protein DnaJ  45.59 
 
 
377 aa  57.4  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.29 
 
 
334 aa  57.4  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4013  chaperone DnaJ-like  32.38 
 
 
333 aa  57.4  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.183455  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  43.08 
 
 
386 aa  57.4  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0213  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.24 
 
 
291 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  39.39 
 
 
387 aa  57.4  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0496  co-chaperone protein DnaJ  41.27 
 
 
294 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0272184  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02238  DnaJ domain protein Psi, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07340)  39.71 
 
 
377 aa  57  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542195  normal  0.0811515 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2911  heat shock protein DnaJ domain protein  50.77 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000293792  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2086  DnaJ domain-containing protein  39.06 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000110327  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1147  chaperone protein DnaJ  39.06 
 
 
373 aa  57  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5932  heat shock protein DnaJ domain protein  47.37 
 
 
209 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.821912  normal  0.100571 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0805  protein translation intiation inhibitor  40 
 
 
296 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000779647  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11700  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  51.72 
 
 
376 aa  57  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.482497  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 
384 aa  57  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  39.06 
 
 
307 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1768  heat shock protein DnaJ-like  38.24 
 
 
415 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0454464  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  42.42 
 
 
376 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2103  heat shock protein DnaJ domain protein  32.19 
 
 
220 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000586336  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1582  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
395 aa  56.2  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  44.12 
 
 
333 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0554  heat shock protein DnaJ-like  36.51 
 
 
290 aa  55.8  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0083  chaperone protein DnaJ  42.65 
 
 
374 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1065  DnaJ domain-containing protein  39.68 
 
 
298 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  46.48 
 
 
385 aa  56.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  39.44 
 
 
380 aa  56.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1308  DnaJ-like molecular chaperone  37.68 
 
 
309 aa  56.2  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.571116  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf297  heat shock protein DnaJ  40.91 
 
 
369 aa  56.2  0.0000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.302595  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3162  chaperone DnaJ domain protein  44.26 
 
 
387 aa  55.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.354519  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13440  chaperone protein DnaJ  34.78 
 
 
372 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84519  Molecular chaperone (DnaJ superfamily)  40 
 
 
344 aa  56.6  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.35649  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
381 aa  55.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2348  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
380 aa  55.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.576372  normal  0.374369 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
370 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14880  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  57.81 
 
 
318 aa  55.8  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3177  heat shock protein DnaJ-like protein  38 
 
 
261 aa  55.5  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12360  chaperone protein DnaJ  48.33 
 
 
377 aa  55.8  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0467451  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
370 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4361  chaperone protein DnaJ  42.03 
 
 
396 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00606286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>