More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0797 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0797  heat shock protein DnaJ domain protein  100 
 
 
369 aa  763    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.95295 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  39.25 
 
 
380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  40.07 
 
 
373 aa  186  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  38.97 
 
 
370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  38.97 
 
 
370 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
382 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07680  chaperone protein DnaJ  38.01 
 
 
373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.447562 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1647  chaperone protein DnaJ  39.32 
 
 
379 aa  182  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51193  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0796  chaperone protein DnaJ  36.98 
 
 
397 aa  180  4e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.751342 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1437  chaperone protein DnaJ  36.36 
 
 
379 aa  180  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  41.3 
 
 
375 aa  179  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  37.16 
 
 
376 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0164  chaperone protein DnaJ  38 
 
 
377 aa  177  3e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  38.99 
 
 
376 aa  176  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  38.64 
 
 
366 aa  176  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1344  chaperone protein DnaJ  38.7 
 
 
376 aa  176  8e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00161  chaperone protein DnaJ  38.7 
 
 
376 aa  176  8e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.296062  normal  0.971864 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  38.63 
 
 
376 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  40.29 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  38.63 
 
 
376 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  38.63 
 
 
376 aa  175  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  38.63 
 
 
376 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  38.63 
 
 
376 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  40.29 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  38.63 
 
 
376 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  38.63 
 
 
376 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  38.63 
 
 
376 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  37.27 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  37.32 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  42.54 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  38.91 
 
 
379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  38.91 
 
 
379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  38.91 
 
 
379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  38.91 
 
 
379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  38.91 
 
 
379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0707  chaperone protein DnaJ  39.56 
 
 
383 aa  173  5e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000115136  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  37.32 
 
 
359 aa  173  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  40.73 
 
 
382 aa  172  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10330  chaperone protein DnaJ  36.61 
 
 
375 aa  172  7.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0686048  unclonable  0.00000000184085 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1825  chaperone protein DnaJ  36.13 
 
 
377 aa  172  9e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0211  chaperone protein DnaJ  38 
 
 
385 aa  172  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  36.25 
 
 
384 aa  170  4e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  37.28 
 
 
379 aa  169  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  36.5 
 
 
385 aa  169  6e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  38.55 
 
 
379 aa  169  7e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  38.55 
 
 
379 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  38.55 
 
 
379 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4164  chaperone protein DnaJ  38.64 
 
 
368 aa  169  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000033123  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  38.49 
 
 
372 aa  168  1e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  36.61 
 
 
375 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  39.29 
 
 
382 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0823  chaperone protein DnaJ  36.86 
 
 
388 aa  167  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  40.36 
 
 
377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  37.33 
 
 
377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  37.72 
 
 
381 aa  167  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4212  chaperone protein DnaJ  37.12 
 
 
371 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000364555  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4050  chaperone protein DnaJ  37.12 
 
 
371 aa  166  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  5.16235e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4538  chaperone protein DnaJ  37.12 
 
 
371 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000345209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4335  chaperone protein DnaJ  37.12 
 
 
371 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7152000000000002e-45 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0451  chaperone protein DnaJ  37.87 
 
 
371 aa  166  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.240923 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4060  chaperone protein DnaJ  37.12 
 
 
371 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353838  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0979  hypothetical protein  33.1 
 
 
379 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127432 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0018  chaperone protein DnaJ  35.22 
 
 
388 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.253679  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0017  chaperone protein DnaJ  35.56 
 
 
374 aa  166  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.629489  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00161  chaperone protein DnaJ  36.74 
 
 
374 aa  166  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4446  chaperone protein DnaJ  38.31 
 
 
371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1244  chaperone protein DnaJ  35.44 
 
 
375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4394  chaperone protein DnaJ  38.31 
 
 
371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000485596  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00161  chaperone protein DnaJ  36.75 
 
 
374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.108884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0804  chaperone protein DnaJ  38.31 
 
 
371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000435348  decreased coverage  1.53546e-22 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0114  chaperone protein DnaJ  36.1 
 
 
391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000234642 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4432  chaperone protein DnaJ  38.31 
 
 
371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000040586  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3432  chaperone protein DnaJ  38.55 
 
 
388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0520699  normal  0.082957 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00171  chaperone protein DnaJ  36.5 
 
 
377 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0387416 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  39.27 
 
 
377 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  37.45 
 
 
389 aa  162  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0009  chaperone protein DnaJ  37.86 
 
 
385 aa  162  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111301  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1751  chaperone protein DnaJ  35.82 
 
 
374 aa  162  8.000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00161  chaperone protein DnaJ  36.98 
 
 
374 aa  162  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.453934  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  39.13 
 
 
378 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  32.53 
 
 
377 aa  162  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  36.46 
 
 
375 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1577  chaperone DnaJ  37.45 
 
 
377 aa  161  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.277961  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  39.49 
 
 
378 aa  161  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0040  chaperone protein DnaJ  36.21 
 
 
372 aa  161  2e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1988  chaperone protein DnaJ  36.82 
 
 
379 aa  161  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.731806  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2235  chaperone protein DnaJ  36.19 
 
 
375 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0177525  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0942  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  37.22 
 
 
377 aa  160  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.122373  normal  0.06017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0527  chaperone protein DnaJ  33.63 
 
 
396 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0020  chaperone protein DnaJ  37.64 
 
 
376 aa  160  4e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1607  chaperone protein DnaJ  33.33 
 
 
355 aa  159  5e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.231275  normal  0.231372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  37.13 
 
 
384 aa  160  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1147  chaperone protein DnaJ  34.72 
 
 
373 aa  159  6e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  34.31 
 
 
374 aa  159  6e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1972  chaperone protein DnaJ  36.94 
 
 
375 aa  159  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000781589 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0129  chaperone protein DnaJ  32.31 
 
 
372 aa  159  8e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1616  chaperone protein DnaJ  34.27 
 
 
352 aa  159  8e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.214383 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  36 
 
 
378 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3470  chaperone protein DnaJ  36.03 
 
 
384 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3522  chaperone protein DnaJ  36.03 
 
 
384 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.495865  normal  0.296321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>