More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1613 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 589 aa  1226    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  55.95 
 
 		 584 aa  681    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  52.03 
 
 		 574 aa  619  1e-176  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  49.9 
 
 		 589 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  45.36 
 
 		 588 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  46.3 
 
 		 586 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  46.3 
 
 		 586 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  46.11 
 
 		 586 aa  503  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  45.92 
 
 		 586 aa  499  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  46.11 
 
 		 586 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  45.92 
 
 		 586 aa  500  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  46.11 
 
 		 586 aa  501  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  46.11 
 
 		 586 aa  500  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  46.11 
 
 		 586 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  46.11 
 
 		 586 aa  501  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  46.49 
 
 		 586 aa  497  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  42.03 
 
 		 610 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  41.65 
 
 		 610 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  41.2 
 
 		 587 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  40.97 
 
 		 574 aa  442  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  38.16 
 
 		 582 aa  423  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  41.03 
 
 		 583 aa  413  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  35.53 
 
 		 575 aa  368  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  43.69 
 
 		 477 aa  344  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  37.81 
 
 		 578 aa  341  2.9999999999999998e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  34.27 
 
 		 586 aa  327  3e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  40.98 
 
 		 472 aa  322  9.999999999999999e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  38.73 
 
 		 481 aa  322  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  30.81 
 
 		 576 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  36.74 
 
 		 481 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  37.5 
 
 		 481 aa  295  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  38.51 
 
 		 496 aa  293  6e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  36.94 
 
 		 483 aa  283  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  38.35 
 
 		 484 aa  280  4e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  38.7 
 
 		 481 aa  275  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  35.49 
 
 		 493 aa  275  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  36.98 
 
 		 481 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  36.8 
 
 		 486 aa  273  6e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  38.11 
 
 		 488 aa  269  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  36.96 
 
 		 486 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  36.96 
 
 		 486 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  38.5 
 
 		 487 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  33.11 
 
 		 459 aa  265  1e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  35.44 
 
 		 663 aa  265  2e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1834  alpha amylase domain-containing protein  35.78 
 
 		 480 aa  259  1e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.108338  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  36.03 
 
 		 715 aa  257  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0501  alpha amylase domain-containing protein  35.07 
 
 		 476 aa  253  6e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.259034  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  33.33 
 
 		 1847 aa  252  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1414  alpha amylase catalytic region  32.63 
 
 		 703 aa  240  5e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0623392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3705  alpha amylase catalytic region  33.41 
 
 		 617 aa  234  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00647332  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  29.24 
 
 		 1401 aa  225  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  30.74 
 
 		 614 aa  224  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002973  maltodextrin glucosidase  30.39 
 
 		 608 aa  223  8e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  28.28 
 
 		 644 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  30.47 
 
 		 914 aa  222  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  29.32 
 
 		 1643 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0369  alpha amylase catalytic region  31.7 
 
 		 659 aa  219  7.999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  29.53 
 
 		 1307 aa  219  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  29.59 
 
 		 576 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  33.03 
 
 		 607 aa  218  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  29.79 
 
 		 606 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  28.66 
 
 		 1401 aa  216  9e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  32.22 
 
 		 473 aa  216  9e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  32.22 
 
 		 473 aa  216  9e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3131  maltodextrin glucosidase  33.03 
 
 		 609 aa  215  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3271  maltodextrin glucosidase  33.03 
 
 		 609 aa  215  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  32.07 
 
 		 475 aa  211  3e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  30.49 
 
 		 580 aa  211  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  33.73 
 
 		 511 aa  207  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1458  alpha amylase, catalytic region  30.82 
 
 		 651 aa  206  9e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  33.8 
 
 		 605 aa  206  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  32.95 
 
 		 1175 aa  204  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  28.21 
 
 		 1753 aa  204  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  31.81 
 
 		 605 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0473  maltodextrin glucosidase  30.65 
 
 		 605 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  31.81 
 
 		 605 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0433  maltodextrin glucosidase  30.65 
 
 		 605 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  31.99 
 
 		 474 aa  202  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3206  alpha amylase catalytic region  30.44 
 
 		 605 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.608393  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00351  maltodextrin glucosidase  30.44 
 
 		 605 aa  201  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0434  maltodextrin glucosidase  31.56 
 
 		 605 aa  201  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00355  hypothetical protein  30.44 
 
 		 605 aa  201  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3230  maltodextrin glucosidase  30.44 
 
 		 605 aa  201  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0440  maltodextrin glucosidase  31.65 
 
 		 605 aa  200  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  33.01 
 
 		 562 aa  200  6e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0480  maltodextrin glucosidase  29.96 
 
 		 604 aa  199  9e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0475  alpha amylase, catalytic region  30.68 
 
 		 608 aa  199  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.350663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2874  alpha amylase catalytic region  29.78 
 
 		 1299 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0286  alpha amylase catalytic region  30.43 
 
 		 611 aa  198  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.109454  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  34.41 
 
 		 510 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0459  maltodextrin glucosidase  31.42 
 
 		 605 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  28.73 
 
 		 600 aa  192  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  28.98 
 
 		 1193 aa  191  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  28.36 
 
 		 479 aa  190  7e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1046  4-alpha-glucanotransferase  28.5 
 
 		 1145 aa  188  2e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  29.49 
 
 		 622 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1265  alpha amylase catalytic region  30.92 
 
 		 463 aa  186  9e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  28.17 
 
 		 635 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17020  glycosidase  27.39 
 
 		 727 aa  177  4e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3328  maltodextrin glucosidase  28.51 
 
 		 596 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.307817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>