210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3431 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  100 
 
 
567 aa  1123    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.07 
 
 
571 aa  267  5e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  35.7 
 
 
572 aa  264  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  36.19 
 
 
607 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.3 
 
 
592 aa  226  8e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  35.23 
 
 
553 aa  226  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  32.97 
 
 
550 aa  220  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.51 
 
 
554 aa  218  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.08 
 
 
554 aa  216  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.4 
 
 
583 aa  210  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.16 
 
 
585 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  29.28 
 
 
596 aa  201  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.28 
 
 
596 aa  201  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.72 
 
 
586 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  29.28 
 
 
596 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.55 
 
 
561 aa  196  9e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  30.77 
 
 
554 aa  194  4e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  30.3 
 
 
548 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.49 
 
 
569 aa  179  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  33.09 
 
 
556 aa  177  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0087  hypothetical protein  29.86 
 
 
581 aa  177  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00223104  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.52 
 
 
578 aa  169  9e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  32.11 
 
 
545 aa  169  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.71 
 
 
595 aa  169  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.77 
 
 
692 aa  165  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  25.96 
 
 
576 aa  164  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1056  hemolysin activation/secretion protein-like  26.34 
 
 
576 aa  163  8.000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000536803  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  29.48 
 
 
567 aa  163  8.000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  29.48 
 
 
567 aa  162  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  29.48 
 
 
567 aa  162  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.92 
 
 
590 aa  161  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  31.49 
 
 
599 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  26.99 
 
 
575 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.89 
 
 
574 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  29.86 
 
 
558 aa  124  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  26.43 
 
 
568 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  26 
 
 
568 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  28.95 
 
 
442 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  23.55 
 
 
692 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1531  hypothetical protein  24.68 
 
 
597 aa  107  5e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.65 
 
 
585 aa  107  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.58 
 
 
559 aa  106  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.46 
 
 
545 aa  105  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000416346 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0771  polypeptide-transport-associated domain protein, ShlB-type  31.39 
 
 
310 aa  104  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.891277 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.15 
 
 
747 aa  104  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4241  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.55 
 
 
581 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.398994  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4351  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.55 
 
 
581 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.891663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3792  hemolysin activator HlyB  25.88 
 
 
575 aa  100  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.609243  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4271  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.63 
 
 
560 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214751  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.3 
 
 
567 aa  99.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02601  activation/secretion signal peptide protein  26.43 
 
 
557 aa  99  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.415625 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1450  TPS family activation/secretion protein  27.38 
 
 
565 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.1 
 
 
546 aa  94.7  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0764  putative outer-membrane protein  25.32 
 
 
508 aa  93.6  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.408754  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.82 
 
 
549 aa  91.7  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.03 
 
 
558 aa  91.7  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  29.18 
 
 
555 aa  90.9  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.34 
 
 
568 aa  90.9  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.57 
 
 
561 aa  90.1  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4169  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.73 
 
 
559 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.987649 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2406  hemolysin activation/secretion protein  23.27 
 
 
547 aa  89.4  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1248  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.75 
 
 
560 aa  89.7  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000540972  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1034  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  25.69 
 
 
561 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1514  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.69 
 
 
561 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0530  putative outer-membrane protein  24.16 
 
 
551 aa  89.4  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1744  hypothetical protein  24.16 
 
 
551 aa  89.4  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.48 
 
 
610 aa  88.6  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1436  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.55 
 
 
561 aa  88.6  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0737479  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1396  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.36 
 
 
561 aa  88.6  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304051  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1457  surface antigen (D15)  26.8 
 
 
555 aa  87.8  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1490  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.48 
 
 
561 aa  87.4  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00938115  hitchhiker  0.0000615286 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0351  hemolysin activation/secretion protein-like protein  25.6 
 
 
607 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410508  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  25.16 
 
 
562 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  24.14 
 
 
569 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  25.16 
 
 
562 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  23.57 
 
 
558 aa  85.9  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  25.26 
 
 
565 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4655  hemolysin activation/secretion protein  25.27 
 
 
561 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55265  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  22.31 
 
 
584 aa  84  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.06 
 
 
560 aa  84  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  25.15 
 
 
562 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  24.36 
 
 
583 aa  83.6  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.84 
 
 
575 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  25.42 
 
 
583 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0354  hemolysin activation/secretion protein  25.46 
 
 
555 aa  82.8  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0188948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2611  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.08 
 
 
543 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.9 
 
 
561 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  0.0000499827 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.07 
 
 
554 aa  81.6  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2095  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.67 
 
 
592 aa  81.3  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  23.61 
 
 
570 aa  80.9  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1086  surface antigen (D15)  24.3 
 
 
550 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0945143  normal  0.205962 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  24.21 
 
 
551 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2806  putative hemolysin activation/secretion signal peptide protein, FhaC/HxuB  25.73 
 
 
569 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.57 
 
 
538 aa  80.5  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  23.32 
 
 
551 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  23.32 
 
 
551 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  23.32 
 
 
551 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  23.38 
 
 
559 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4818  hypothetical protein  24.48 
 
 
544 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  24.02 
 
 
551 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>