More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2944 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2944  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 466 aa  915    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2511  hypothetical protein  42.27 
 
 		 446 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2630  metal dependent phosphohydrolase  43.4 
 
 		 435 aa  317  2e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1533  metal dependent phosphohydrolase  43.18 
 
 		 454 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  35.82 
 
 		 431 aa  277  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  37.33 
 
 		 417 aa  258  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2785  metal dependent phosphohydrolase  44.04 
 
 		 448 aa  255  9e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.576348 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2333  hypothetical protein  31.52 
 
 		 426 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250947  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2078  hypothetical protein  31.38 
 
 		 417 aa  219  8.999999999999998e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000117952  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  31.45 
 
 		 421 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  31.54 
 
 		 418 aa  217  4e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  31.69 
 
 		 421 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 		 419 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  31.61 
 
 		 419 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  32.05 
 
 		 420 aa  213  7e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  32.05 
 
 		 420 aa  213  7e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  32.05 
 
 		 420 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  32.13 
 
 		 421 aa  213  9e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002441  HD-GYP domain-containing protein  31.17 
 
 		 417 aa  206  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000172513  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  30.7 
 
 		 420 aa  206  7e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  30.7 
 
 		 420 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  31.24 
 
 		 420 aa  204  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  31.45 
 
 		 420 aa  203  7e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  30.23 
 
 		 416 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  31.15 
 
 		 420 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03619  hypothetical protein  30 
 
 		 416 aa  196  9e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  31.51 
 
 		 448 aa  180  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1519  putative metal dependent phosphohydrolase  28.16 
 
 		 404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000671855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2362  metal dependent phosphohydrolase  27.41 
 
 		 402 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.014285  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2756  metal dependent phosphohydrolase  27.15 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2677  metal dependent phosphohydrolase  27.15 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0495903  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1571  metal dependent phosphohydrolase  26.94 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000899891 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1707  metal dependent phosphohydrolase  27.15 
 
 		 401 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.336199  hitchhiker  0.00000000228232 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1691  metal dependent phosphohydrolase  26.54 
 
 		 398 aa  139  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0771353  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  28.93 
 
 		 400 aa  140  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1740  metal dependent phosphohydrolase  26.75 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0020457  hitchhiker  0.000000139322 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1577  metal dependent phosphohydrolase  27.37 
 
 		 401 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2844  metal dependent phosphohydrolase  25.6 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021567 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  31.66 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  29.23 
 
 		 413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  29.47 
 
 		 439 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2642  metal dependent phosphohydrolase  27.06 
 
 		 401 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  29.29 
 
 		 403 aa  133  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2459  metal dependent phosphohydrolase  28.35 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  29.47 
 
 		 413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  28.43 
 
 		 404 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  34.34 
 
 		 412 aa  126  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  28.61 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  33.92 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  25.89 
 
 		 401 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  28.43 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  29.05 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  28 
 
 		 436 aa  124  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  37.13 
 
 		 388 aa  124  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  28.54 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  30.89 
 
 		 419 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 		 448 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1095  putative metal dependent phosphohydrolase  34.54 
 
 		 435 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1510  metal dependent phosphohydrolase  27.24 
 
 		 401 aa  121  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.933649  hitchhiker  0.00011733 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  30.42 
 
 		 448 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2512  hypothetical protein  27.48 
 
 		 406 aa  120  6e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  27.86 
 
 		 419 aa  120  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2862  HDIG domain-containing protein  26.93 
 
 		 401 aa  119  9e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  36.08 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  31.76 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  33.5 
 
 		 410 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  27.74 
 
 		 407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3058  metal dependent phosphohydrolase  32.6 
 
 		 352 aa  118  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  27.94 
 
 		 404 aa  117  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  32.89 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  34.01 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  28.17 
 
 		 411 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  26.24 
 
 		 402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  32.35 
 
 		 417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  28.09 
 
 		 419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  32.46 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  25.27 
 
 		 399 aa  114  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  28.43 
 
 		 429 aa  113  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  27.3 
 
 		 446 aa  113  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  26.52 
 
 		 410 aa  113  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  33.85 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  31.63 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  33.85 
 
 		 369 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2302  HD domain-containing protein  27.39 
 
 		 421 aa  111  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.332838  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  30.45 
 
 		 390 aa  111  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  28.44 
 
 		 350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  29.07 
 
 		 414 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1030  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 353 aa  110  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.239219  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  31.14 
 
 		 398 aa  110  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  32.64 
 
 		 386 aa  110  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  29.33 
 
 		 364 aa  109  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1930  metal dependent phosphohydrolase  31.56 
 
 		 379 aa  108  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.421896  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2680  HD-GYP domain-containing protein  26.82 
 
 		 488 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.467072 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  28.68 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  29.82 
 
 		 400 aa  107  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  31.44 
 
 		 405 aa  107  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  28.37 
 
 		 392 aa  107  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  30.7 
 
 		 392 aa  106  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  30.3 
 
 		 394 aa  106  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  33.5 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>