More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1065 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 335 aa  680    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  54.52 
 
 		 330 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  54.35 
 
 		 330 aa  357  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  50.76 
 
 		 334 aa  343  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  46.93 
 
 		 337 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  45.99 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  45.99 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  46.01 
 
 		 342 aa  268  8e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  44.31 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  43.28 
 
 		 328 aa  256  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  41.34 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  40.91 
 
 		 328 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  43.45 
 
 		 330 aa  251  9.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  41.27 
 
 		 328 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  42.99 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  39.04 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  39.08 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  37.27 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  37.65 
 
 		 336 aa  192  8e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  37.31 
 
 		 344 aa  189  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  39.63 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  36.53 
 
 		 324 aa  179  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  36.34 
 
 		 325 aa  178  9e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  35.33 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.33 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  34.74 
 
 		 326 aa  170  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  35.1 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  33.33 
 
 		 388 aa  160  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  34.53 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  34.64 
 
 		 343 aa  153  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  32.09 
 
 		 667 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  32.14 
 
 		 332 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  33.03 
 
 		 329 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  32.83 
 
 		 329 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  34.88 
 
 		 327 aa  136  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  33.85 
 
 		 345 aa  136  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  30.36 
 
 		 342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  32.61 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  35.29 
 
 		 331 aa  129  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  29.67 
 
 		 342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  30.79 
 
 		 356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3970  oxidoreductase domain-containing protein  33.75 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000828304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 337 aa  126  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  32.18 
 
 		 667 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  28.82 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  30.98 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  30.27 
 
 		 384 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  30.27 
 
 		 384 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  32.82 
 
 		 354 aa  122  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.76 
 
 		 327 aa  122  7e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  30.27 
 
 		 384 aa  122  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2611  oxidoreductase domain-containing protein  33.45 
 
 		 320 aa  122  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 		 435 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  28.99 
 
 		 435 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  32.34 
 
 		 667 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  36.71 
 
 		 352 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 		 435 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  27.52 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  31.7 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  30.97 
 
 		 374 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4277  oxidoreductase domain-containing protein  28.33 
 
 		 325 aa  119  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  29.12 
 
 		 370 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  32.77 
 
 		 338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  30.68 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  27.41 
 
 		 432 aa  116  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 		 667 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  30.25 
 
 		 325 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  32.3 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1266  oxidoreductase domain-containing protein  33 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.051874  hitchhiker  0.000127029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  25.73 
 
 		 468 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 329 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  27.97 
 
 		 329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  37.11 
 
 		 334 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  31.79 
 
 		 363 aa  112  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 		 458 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  30.24 
 
 		 374 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  34.22 
 
 		 408 aa  109  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  32.56 
 
 		 342 aa  109  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  34.96 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  30.04 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.08 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  29.26 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  28.09 
 
 		 405 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  28.74 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  42.77 
 
 		 344 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3608  oxidoreductase domain-containing protein  37.84 
 
 		 340 aa  106  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3482  oxidoreductase domain protein  31.47 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2241  oxidoreductase domain protein  28.41 
 
 		 361 aa  106  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  0.22056 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  29.36 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  28.99 
 
 		 356 aa  105  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  29.36 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  33.61 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  28.28 
 
 		 433 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  29.82 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  36.56 
 
 		 382 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03524  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  31.82 
 
 		 416 aa  103  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00618611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  29.8 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  34.38 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  37.23 
 
 		 382 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>