276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1872 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1872  F0F1-type ATP synthase, delta subunit  100 
 
 
180 aa  347  4e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.06 
 
 
178 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.48 
 
 
178 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.17 
 
 
182 aa  95.5  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.49 
 
 
180 aa  91.7  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  31.46 
 
 
190 aa  89.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.91 
 
 
180 aa  89  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.91 
 
 
180 aa  89  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.91 
 
 
180 aa  89  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.91 
 
 
180 aa  89  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.91 
 
 
180 aa  89  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.91 
 
 
180 aa  87.8  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.91 
 
 
180 aa  87.8  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.91 
 
 
180 aa  87.8  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.91 
 
 
180 aa  87  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.33 
 
 
180 aa  85.1  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.58 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1936  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.9 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.32 
 
 
181 aa  80.9  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.06 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  32.09 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.99 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.88 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.47 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.92 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  29.24 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.47 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3077  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.97 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26673  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.01 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0662  F0F1-type ATP synthase, delta subunit  27.59 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2872  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.11 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.12 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  27.81 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  21.97 
 
 
179 aa  72  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  28.9 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.39 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.58 
 
 
183 aa  70.9  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.71 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0182  ATPase, delta subunit (H(+)-transporting two-sector ATPase)  29.59 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.861028 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  29.65 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  26.32 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.18 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  29.55 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.16 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  22.41 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  26.99 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  25.73 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.82 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0561  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.24 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.132233  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0518  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.16 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  25 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_500  ATP synthase F1, delta subunit  29.24 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0258764  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.64 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4149  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.79 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0979605  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.14 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4199  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.79 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  0.940305 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4258  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.79 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.510184  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4093  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.79 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4078  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.79 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.079303  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4465  ATP synthase F1, delta subunit  30 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00110137  hitchhiker  0.0000000108481 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  26.79 
 
 
178 aa  67.4  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  29.41 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4243  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 
177 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000376424  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0009  ATP synthase F1, delta subunit  29.05 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  27.38 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.26 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4205  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.19 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000051054  normal  0.165641 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  26.74 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.16 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.61 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4048  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.24 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572688  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4223  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.19 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000462366  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4179  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.19 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3990  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934211  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  23.6 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5602  ATP synthase F1, delta subunit  27.38 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  26.9 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  26.86 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.87 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.37 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.21 
 
 
178 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1715  ATP synthase F1, delta subunit  27.49 
 
 
182 aa  63.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000459398  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  28 
 
 
179 aa  64.3  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 
181 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0064  ATP synthase F1 subunit delta  25.15 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4254  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.73 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.177027  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5124  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.79 
 
 
178 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.863545 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.37 
 
 
186 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4191  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.81 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000591932  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0200  ATP synthase F1, delta subunit  26.47 
 
 
175 aa  62.8  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0296098  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.84 
 
 
178 aa  62  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  26.63 
 
 
190 aa  62  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1699  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.96 
 
 
182 aa  62  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.315472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>