More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_21660 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_21660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 274 aa  548  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0380477  normal  0.0820777 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0669  ABC transporter related  70.37 
 
 		 247 aa  351  7e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0798533 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07290  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  70.04 
 
 		 245 aa  345  5e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219911  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4597  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP- binding protein  65.89 
 
 		 271 aa  344  8e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29460  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  66.8 
 
 		 254 aa  340  1e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5218  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  63.2 
 
 		 278 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0306  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  64.34 
 
 		 267 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137592  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1748  ABC transporter related  59.52 
 
 		 271 aa  296  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4371  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  55.08 
 
 		 277 aa  292  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0064  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.35 
 
 		 261 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684363 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3700  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  55.95 
 
 		 261 aa  288  6e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2323  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  55.95 
 
 		 257 aa  288  7e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483469  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0280  ABC transporter related  55.95 
 
 		 261 aa  288  7e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2156  ABC transporter related  53.33 
 
 		 267 aa  288  7e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5235  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  56.13 
 
 		 261 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.251626 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5514  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  55.95 
 
 		 261 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.595344  hitchhiker  0.000996868 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3869  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  52.17 
 
 		 295 aa  277  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3170  hypothetical protein  55.16 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3462  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  55.6 
 
 		 254 aa  276  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4425  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54 
 
 		 255 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0749  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  52.21 
 
 		 282 aa  268  8e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000330465  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2965  ABC transporter  53.03 
 
 		 265 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0568085  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  52.59 
 
 		 263 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  50.58 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  53.78 
 
 		 254 aa  262  6e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  50.39 
 
 		 256 aa  260  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  52.4 
 
 		 244 aa  259  3e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  50.59 
 
 		 260 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  51.35 
 
 		 263 aa  256  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  54.92 
 
 		 258 aa  257  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  50.57 
 
 		 268 aa  256  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  51.22 
 
 		 243 aa  256  4e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  53.57 
 
 		 256 aa  255  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  54 
 
 		 243 aa  255  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  51.22 
 
 		 243 aa  254  8e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  52.03 
 
 		 240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  52.19 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  52.4 
 
 		 273 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  55.28 
 
 		 246 aa  253  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  52 
 
 		 243 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  50.4 
 
 		 256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  52.85 
 
 		 243 aa  252  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  50.8 
 
 		 263 aa  252  5.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  50.81 
 
 		 243 aa  252  6e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  51.13 
 
 		 274 aa  251  7e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  50.83 
 
 		 254 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  50 
 
 		 255 aa  250  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.19 
 
 		 240 aa  249  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1137  ABC transporter related  51.19 
 
 		 254 aa  250  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  50 
 
 		 254 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  50.4 
 
 		 252 aa  250  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.24 
 
 		 592 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  48.44 
 
 		 254 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  55.2 
 
 		 243 aa  249  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  49.19 
 
 		 240 aa  249  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  52.61 
 
 		 248 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  52.85 
 
 		 240 aa  249  4e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  52.44 
 
 		 243 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  51.02 
 
 		 250 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  50.61 
 
 		 261 aa  248  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  48.45 
 
 		 259 aa  248  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  49.59 
 
 		 267 aa  248  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.44 
 
 		 244 aa  248  6e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  52 
 
 		 240 aa  248  6e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.58 
 
 		 595 aa  248  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  51.03 
 
 		 245 aa  248  8e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  48.45 
 
 		 267 aa  248  8e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2272  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.65 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  50 
 
 		 242 aa  247  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  53.06 
 
 		 244 aa  248  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  49.21 
 
 		 259 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2374  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.65 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.90212  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  48.84 
 
 		 257 aa  247  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  53.5 
 
 		 248 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  50.2 
 
 		 250 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  51.85 
 
 		 243 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  50.62 
 
 		 245 aa  246  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  49.6 
 
 		 254 aa  246  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.19 
 
 		 594 aa  245  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.24 
 
 		 250 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3589  ABC transporter related  52.8 
 
 		 243 aa  245  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  48.66 
 
 		 256 aa  246  4e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  47.43 
 
 		 254 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  49.79 
 
 		 263 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  48.4 
 
 		 240 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  51.44 
 
 		 240 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  48.16 
 
 		 242 aa  245  6e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  49.6 
 
 		 252 aa  245  6.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  50.61 
 
 		 242 aa  244  8e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.26 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2303  ABC transporter related protein  50.62 
 
 		 246 aa  244  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000265903  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0694  ABC transporter related  50 
 
 		 245 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  50.2 
 
 		 242 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  52.65 
 
 		 252 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  50.8 
 
 		 241 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  47.33 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2033  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.24 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  49.2 
 
 		 249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3380  ABC transporter related  51.61 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679139  normal  0.283107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>