More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17260 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_17260  selenocysteine lyase  100 
 
 		 413 aa  818    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.118877  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3072  aminotransferase class V  45.61 
 
 		 357 aa  264  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237704  decreased coverage  0.0000000313902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2385  aminotransferase class V  37.94 
 
 		 357 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00212379  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0028  hypothetical protein  40.46 
 
 		 368 aa  231  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0933  aminotransferase class V  41.67 
 
 		 351 aa  227  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1864  aminotransferase class V  36.24 
 
 		 352 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.126544  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4796  aminotransferase class V  38.78 
 
 		 362 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.688685 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1463  aminotransferase class V  39.04 
 
 		 352 aa  209  7e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1984  aminotransferase class V  37.71 
 
 		 345 aa  206  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.817831  hitchhiker  0.0000368323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1785  aminotransferase class V  39.88 
 
 		 347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0698  aminotransferase, class V  35.55 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0712  aminotransferase, class V  35.55 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0520963 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5841  aminotransferase class V  35.36 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0692  aminotransferase, class V  35.55 
 
 		 347 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0756141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4459  aminotransferase class V  34.51 
 
 		 341 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  unclonable  0.0000000253677  hitchhiker  0.00260881 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1799  aminotransferase, class V  39 
 
 		 347 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14510  hypothetical protein  38.4 
 
 		 334 aa  153  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  30.34 
 
 		 381 aa  94.7  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  29.32 
 
 		 381 aa  90.1  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  26.98 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  23.85 
 
 		 376 aa  87  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4343  selenocysteine lyase  31.09 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4498  aminotransferase class V  31.46 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4479  aminotransferase class V  31.46 
 
 		 384 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3922  aminotransferase class V  25.95 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3417  kynureninase  26.23 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.746937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0295  aminotransferase, class V  25.13 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2438  aminotransferase class V  26.8 
 
 		 398 aa  79.7  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3724  aminotransferase, class V  24.87 
 
 		 374 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0295  aminotransferase, class V  24.47 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286273 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  30.6 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02090  hypothetical protein  25.53 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.468544  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3556  aminotransferase, class V  28.57 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4413  kynureninase  26.45 
 
 		 378 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  27.27 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0407  aminotransferase, class V  24.46 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482772  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2118  kynureninase  28.85 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.489178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  25.46 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5365  aminotransferase class V  28.28 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  0.71759 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  25 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13338  hypothetical isopenicillin N epimerase  21.37 
 
 		 361 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  24.4 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  27.35 
 
 		 391 aa  67  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  22.74 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0309  aminotransferase class V  25.85 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2100  kynureninase  29.17 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0304  aminotransferase class V  25.85 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  28.63 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  26.35 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  26.99 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0300  aminotransferase class V  25.42 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.9 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0305  aminotransferase class V  25.42 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3396  kynureninase  29.71 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1471  kynureninase  26.89 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0396616  normal  0.0356277 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  27.55 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  25.23 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  37.14 
 
 		 449 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4470  kynureninase  27.05 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0679  kynureninase  28.68 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  29.76 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3452  aminotransferase, class V  22.58 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.237823  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  27.69 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5082  aminotransferase class V  27.5 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000086974  normal  0.0923906 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  22.16 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  25.62 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3511  kynureninase  30.04 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  26.35 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2620  kynureninase  28.63 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.756283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  29.86 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0411  aminotransferase, class V  24.11 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  25.29 
 
 		 379 aa  57  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0603  selenocysteine lyase  32.19 
 
 		 424 aa  57  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  26.45 
 
 		 381 aa  57  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  27.39 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  23.61 
 
 		 569 aa  56.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  25.51 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf184  nitrogen fixation protein NifS  25.14 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.281277  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.48 
 
 		 432 aa  55.8  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.07 
 
 		 572 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  22.86 
 
 		 385 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0386  cysteine desulfurase, SufS family protein  30.97 
 
 		 452 aa  55.1  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.559739 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2279  cysteine desulfurase  26.02 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0879534  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.31 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1473  kynureninase  29.69 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  27.9 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6583  aminotransferase, class V  30.87 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.639471 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  23.43 
 
 		 377 aa  54.7  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21101  putative L-cysteine/cystine lyase  23.53 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  31.18 
 
 		 382 aa  54.3  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0190  alanine--glyoxylate transaminase  23.5 
 
 		 384 aa  54.3  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0814206  normal  0.663999 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  25.73 
 
 		 355 aa  54.3  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0822  kynureninase  25.55 
 
 		 416 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.632925  hitchhiker  0.00000920194 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3208  kynureninase  25.95 
 
 		 416 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  26.14 
 
 		 414 aa  53.5  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2386  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.22 
 
 		 426 aa  53.5  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168267  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5192  kynureninase  27.69 
 
 		 409 aa  53.5  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.491737 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3484  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.38 
 
 		 442 aa  53.5  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  22.28 
 
 		 419 aa  53.5  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.674845 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0407  cysteine desulphurases, SufS  26.53 
 
 		 428 aa  53.1  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>